Označavanje gena
From Wikipedia, the free encyclopedia
Označavanje gena, obilježavanje gena ili anotacija gena i/ili DNK/genoma je postupak identifikacije lokacije gena i svih kodirajućih regija u genomu i utvrđivanje njihovog djelovanja. Oznaka (bez obzira na kontekst) je dodatak u obliku objašnjenja ili komentara. Jednom kada se genom sekvencira, potrebno ga je označiti da bi to imalo smisla.[1]
Za obilježavanje DNK, prethodno nepoznata sekvenca predstavljanja genetičkog materijala obogaćena je informacijama koje se odnose genomski položaj do granica intron – egzon, regulacijska sekvenca , ponavljanja, imena gena i proteinskih proizvoda. Ova oznaka pohranjena je u genomskim bazama podataka kao to su Informatika o mišjem genomu, FlyBaza i WormBaza. Obrazovni materijali o nekim aspektima bioloških anotacija iz 2006 Gene Ontology anotacijskog kampa i slični događaji dostupni su na web lokaciji Gene Ontology.[2]
Nacionalni centar za biomedicinsku ontologiju (www.bioontology.org) razvio je alate za automatizirano označavanje[3] oznaka baze podataka na osnovu tekstnih opisa tih zapisa.
Kao općeniti metod, dcGO[4] ima automatiziranu proceduru za statističko zaključivanje asocijacija između pojmova ontologije i proteinskih domena ili kombinacija domena iz postojećih zapisa na nivou gena/proteina.