Prosite

PROSITE és una base de dades de famílies de proteïnes i dominis proteics.

Prosite

URL	http://prosite.expasy.org/
Tipus	base de dades biològica i base de dades en línia
Llengua	anglès
Part de	SIB Swiss Institute of Bioinformatics (en)
Creador	Amos Bairoch
Mantenidor	SIB Swiss Institute of Bioinformatics (en)

Aquesta base de dades consisteix en un conjunt d'entrades que recullen la descripció dels dominis, les famílies i els llocs funcionals, així com les seqüències d'aminoàcids característiques de les proteïnes d'interès. Prosite va ser creat el 1988 per Amos Bairoch i actualment és elaborada pel Swiss Institute of Bioinformatics.

Els seus usos més habituals inclouen la predicció de dominis i funcions per a noves proteïnes i l'anàlisi de proteïnes ja conegudes a la cerca de funcions no predites anteriorment. Prosite forma part de les eines d'anàlisi orientades a la proteòmica que ofereix el servidor ExPASy i està integrada en la base de dades de proteïnes Swiss-Prot

Vegeu també

• Uniprot
• InterPro

Referències

• Hulo N., Bairoch A., Bulliard V., Cerutti L., Cuche B., De Castro E., Lachaize C., Langendijk-Genevaux P.S., Sigrist C.J.A. «The 20 years of PROSITE.». Nucleic Acids Res., 2007. PMID: 18003654.
• De Castro E., Sigrist C.J.A., Gattiker A., Bulliard V., Langendijk-Genevaux P.S., Gasteiger E., Bairoch A., Hulo N. «ScanProsite: detection of PROSITE signature matches and ProRule-associated functional and structural residues in proteins.». Nucleic Acids Res., 34(Web Server issue), 2006, pàg. W362–365. PMID: 16845026.
• Sigrist CJ, De Castro E, Langendijk-Genevaux PS, Le Saux V, Bairoch A, Hulo N. «ProRule: a new database containing functional and structural information on PROSITE profiles.». Bioinformatics., 21(21), 2005, pàg. 4060–4066. DOI: 10.1093/bioinformatics/bti614. PMID: 16091411.

Enllaços externs

• http://www.expasy.org/prosite/