Agri ligger på Djursland mellem byerne Knebel og Egens. Agri er en lille landsby på Mols højt placeret i terrænet. Øst for Agri ligger Mols' højeste bakketop, Agri Bavnehøj, og vest for et tilsvarende udsigtspunkt, Stabelhøje. Agri ligger i Syddjurs Kommune og hører til Region Midtjylland. Den lille sø, som Agri ligger omkring, siges at være Danmarks højest beliggende sø, 97 m. o. h.