Gernersgade er en gade ved Nyboder i Indre By i København, der ligger mellem Store Kongensgade og Rigensgade. Gaden er opkaldt efter skibskonstruktør Henrik Gerner (1741-1787), der i sine sidste år var leder af skibsbyggeriet på Holmen, og som blandt andet opfandt hestetrukne muddermaskiner. Navnet skal ses i sammenhæng med det nærliggende kvarter Nyboder.