EcoRI

EcoRI ist ein Enzym aus der Familie der Nukleasen. Es war die erste Nuklease I aus dem Stamm R von Escherichia coli. Es findet insbesondere in der Molekularbiologie Anwendung als Restriktionsenzym. Das Enzym besteht aus einem Homodimer und schneidet doppelsträngige DNA innerhalb der palindromischen Erkennungssequenz unter Bildung eines 5'-Überhangs wie folgt:

Erkennungssequenz	Restriktionsschnitt
5'-GAATTC-3' 3'-CTTAAG-5'	5'-G AATTC-3' 3'-CTTAA G-5'

EcoRI
Bändermodell mit DNA nach PDB 1QPS
Vorhandene Strukturdaten: 1ckq, 1cl8, 1eri, 1qc9, 1qps, 1qrh, 1qri, 2oxv
Masse/Länge Primärstruktur	276 Aminosäuren
Sekundär- bis Quartärstruktur	Homodimer
Kofaktor	2 Mg2+
Bezeichner
Externe IDs	UniProt P00642
Enzymklassifikation
EC, Kategorie	3.1.21.4, Restriktionsenzym
Reaktionsart	Hydrolyse
Substrat	GAATTC (dDNA)
Vorkommen
Homologie-Familie	ECOR1
Übergeordnetes Taxon	Proteobakterien

Diese Ausbildung eines 4-Basen-Überhangs („sticky ends“) wird in der Molekularbiologie bei der erleichterten Ligation von DNA-Fragmenten ausgenutzt. Unter bestimmten Bedingungen zeigt EcoRI eine verminderte Selektivität für die Erkennungssequenz (Star-Aktivität).

Weblinks

• REBASE: EcoRI

Normdaten (Sachbegriff): GND: 4266680-6 (GND Explorer, lobid, OGND)