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Haushaltsgen

Art von Gen Aus Wikipedia, der freien Enzyklopädie

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Ein Haushaltsgen (auch englisch housekeeping gene, nicht-reguliertes Gen, konstitutiv exprimiertes Gen) ist ein Gen, welches unabhängig von Zelltyp, Zellstadium und äußeren Einflüssen exprimiert wird (meistens basal), im Gegensatz zu den regulierten Genen.[1][2]

Haushaltsgene sind typischerweise Gene, die die Strukturmoleküle und Enzyme, die mit dem Grundstoffwechsel von Zellen zusammenhängen, beispielsweise mit dem Glukose-Stoffwechsel, codieren.[3]

Sie enthalten oft keine TATA-Box, dafür aber CAAT- oder GC-Boxen.[4] Die GC-Box (Sequenz GGGCGG) ist der Promotor von Haushaltsgenen.[5]

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Haushaltsgene des Menschen

Zusammenfassung
Kontext

Genexpression

Transkriptionsfaktoren

Thumb
SREBP Sterol Regulatory Element Binding Protein
  • ATF4[6][7] aktivierender Transkriptionsfaktor 4
  • BTF3[6][7]
  • E2F4[6]
  • ERH (Gen)[6][7] Enhancer of rudimentary homolog of drosophila (wird benötigt für den ersten enzymatischen Schritt in der Pyrimidin-Synthese. Reguliert durch MITF)
  • HMGB1[6][7] High-Mobility-Group-Protein B1, bindet DNA
  • ILF2[6]
  • IER2[6] früher ETR101 Immediate Early Protein
  • JUND[6][7]
  • LTBP4[6]
  • LMO1[6] Rhombotin 1
  • MYC[6][7] bei Mutationen auch als Onkogen betrachtet. Reguliert die Transkription von 15 % aller Gene.
  • PAX8[6]
  • PHF1[6][7] Plant homology domain
  • PTTG1IP[6]
  • SREBF1[6] Sterol Regulatory Element Binding Protein Smith Magenis
  • TBP[8] synonym TATA-binding protein oder GTF2D oder TFIID
  • TCEB2[6][7] Elongin
  • TCOF1[6] interagiert mit UBF
Repressoren
  • ANF91, HPF7, HTF10[6] Kruppel Associated Box domain
  • ID3 (gene)[6] hemmt die DNA-Bindung
  • PUF60[6][7]
  • NFKBIA[6][7] Genprodukt IκBα hemmt NF-κB
  • RING1[6]

Spleißen

Thumb
Small nuclear ribonucleoprotein-assoziierte Proteine B und B'

Translationsfaktoren

tRNA-Synthetasen

Gene die für Aminoacyl-tRNA-Synthetasen codieren, auch mitochondriale (2):

  • AARS Alanyl-tRNA-Synthetase NM_001605
  • AARSD1 Alanyl-tRNA-Synthetase-Domäne 1 enthaltend NM_001261434
  • AARS2 Alanyl-tRNA-Synthetase 2, mitochondrial NM_020745
  • CARS Cysteinyl-tRNA-Synthetase NM_001751
  • CARS2 Cysteinyl-tRNA-Synthetase 2, mitochondrial (vorgeschlagen) NM_024537
  • DARS Aspartyl-tRNA-Synthetase NM_001349
  • DARS2 Aspartyl-tRNA-Synthetase 2, mitochondrial NM_018122
  • EARS2 Glutamyl-tRNA-Synthetase 2, mitochondrial (vorgeschlagen) NM_001083614
  • EPRS Bifunktionelle Glutamyl/Prolyl-tRNA-Synthetase
  • FARSA Phenylalanyl-tRNA-Synthetase, alpha-Untereinheit NM_004461
  • FARSB Phenylalanyl-tRNA-Synthetase, beta-Untereinheit NM_005687
  • FARS2 Phenylalanyl-tRNA-Synthetase 2, mitochondrial NM_006567
  • HARS Histidyl-tRNA-Synthetase NM_002109
  • HARS2 Histidyl-tRNA-Synthetase 2, mitochondrial NM_012208
  • IARS Isoleucyl-tRNA-Synthetase NM_002161
  • IARS2 Isoleucyl-tRNA-Synthetase 2, mitochondrial NM_018060
  • LARS Leucyl-tRNA-Synthetase
  • LARS2 Leucyl-tRNA-Synthetase 2, mitochondrial NM_015340
  • MARS Methionyl-tRNA-Synthetase NM_004990
  • MARS2 Methionyl-tRNA-Synthetase 2, mitochondrial NM_138395
  • NARS Asparaginyl-tRNA-Synthetase NM_004539
  • NARS2 Asparaginyl-tRNA-Synthetase 2, mitochondrial (vorgeschlagen) NM_024678
  • PARS2 Prolinyl-tRNA-Synthetase 2, mitochondrial (vorgeschlagen)
  • RARS Arginyl-tRNA-Synthetase NM_002884
  • RARS2 Arginyl-tRNA-Synthetase 2, mitochondrial NM_020320
  • SARS Seryl-tRNA-Synthetase NM_006513
  • SARS2 Seryl-tRNA-Synthetase 2, mitochondrial
  • TARS Threonyl-tRNA-Synthetase NM_152295
  • TARS2 Threonyl-tRNA-Synthetase 2, mitochondrial
  • VARS Valyl-tRNA-Synthetase
  • VARS2 Valyl-tRNA-Synthetase 2, mitochondrial NM_020442
  • TARS Tryptophanyl-tRNA-Synthetase
  • WARS2 Tryptophanyl-tRNA-Synthetase 2, mitochondrial NM_015836
RNA-bindende Proteine
  • PABPC1[6] PolyA-bindendes Protein
  • ELAVL3[6]

Ribosomale Proteine

RNA-Polymerasen

Proteinprozessierung

  • Cyclophilin A[8] Serin/Threonin-Phosphatase-Inhibitor, beteiligt an der Proteinfaltung
  • CANX[6][7] Faltet Glycoproteine im Endoplasmatischen Reticulum
  • CAPNS1[6][7] Calpain-Protease
  • NACA[6][7] Nascent Polypeptide-Associated Complex alpha Polypeptide
  • PFDN1[6] Prefoldin 1
  • PFDN5[6] Prefoldin 5
  • SNX3[6] Sorting Nexin 3
  • SNX17[7]
  • SNX27[7]
  • SSR2[6] Proteintranslokation im ER
  • SUMO2[6][7] Protein-Targeting

Hitzeschockproteine

Histone

  • CDH4[6] Nucleosom-Umbau
  • HIST1H2BC[6]
  • H2AFY[6] Histone 2 Subfamily
  • H2AFZ[6][7] essentiell bei der Embryogenese
  • H3F3A[6][7] H3 Histone Family

Zellzyklus

  • ARHGAP1[6]
  • ARHGDIA[6][7]
  • CENPB[6] Centromere protein B
  • CTBP1[6][7]
  • Cyclophilin
  • CCND3[6]
  • GAS1[6][7] Blockiert Eintritt in die S phase
  • PPP2CB[6] Negative regulator of growth and cell division
  • PPP2R1A[7] Negative regulator of growth and cell division
  • RAD9[6]
  • KIAA0174[6][7] oder IST1 homolog (lokalisiert in der Teilungsebene teilender Zellen)

Apoptose

  • DAD1[6][7] Defender against cell death
  • DAP (gene)[6]
  • DAXX[6] Death Associated Protein 6

Onkogene

DNA-Reparatur und Replikation

  • Ku80[6] synonym XRCC5
  • MCM3AP[6] vermutlich eine Primase

Metabolismus

  • PRKAG1[6] inaktiviert HMGCoA-Reduktase und Acetyl-CoA-Carboxylase

Kohlenhydratmetabolismus

Citratzyklus

Fettstoffwechsel

  • GM2A[6] geringe Expression
  • HADHA[6] Trifunktionales Protein Untereinheit α
  • HADHB[6][7] Trifunktionales Protein Untereinheit β

Aminosäuremetabolismus

Nukleotidsynthese

  • IMPDH2[6][7] Guaninnukleotidbiosynthese

NADH-Dehydrogenasen

Cytochrom-C-Oxidasen

(COX1, COX2 und COX3 werden im Mitochondrium codiert)

ATPasen

Mitochondrial
Lysosomal

Lysosom

Proteasom

Ribonuklease

  • RNH[6][7] Ribonuklease-Hemmstoff

Oxidase/Reduktase

Strukturelle Proteine

Zytoskelett

Organellsynthese

Eine spezielle Form der Zellsignalisierung

  • BLOC1S1[6][7]
  • AP2M1[6]
  • ANXA2[6]
  • ANXA6[6]
  • ANXA7[7]
  • AP1B1[6][7] Endozytose
  • CLTA[6] Clathrin A (Vesikel)
  • CLTB[6][7] Clathrin B (Vesikel)
  • GP2[6][7] enzymatische sekretorische Granula (v. a. im Pankreas)
  • KDELR1[6][7] KDEL-Rezeptor bindet ER-Proteine

Mitochondrium

Zelloberfläche

Zelladhäsion

  • ADAM15[6]
  • Beta-catenin[6]
  • CNTN1[6] Contactin
  • Delta-catenin[7]

Kanäle und Transporter

  • ABCG2[6] früher BCRP1 xenobiotic transporter, gering exprimiert
  • CALM1[6][7] Calmodulin bindet Calciumionen
  • CALM2[6] Calmodulin bindet Calciumionen
  • HPCAL1[6] bindet Calciumionen; exprimiert v. a. in der Retina
  • GRIK5[6]
  • MFSD10 aka TETRAN or tetracycline transporter-like protein[6]
  • TFRC[8] Transferrinrezeptor
  • FOLR1[8] Folatrezeptor
  • SLC25A11[6] mitochondrialer Oxoglutarat/Malat-Transporter

Rezeptoren

HLA, Immunoglobuline und Zellerkennung

Kinasen und Signaltransduktion

  • ADRBK1[6] mindert die Reaktion auf Epinephrin
  • AGPAT1[6][7] 3-Phosphoglycerol-Acyltransferase
  • ARF1[6][7]
  • ARF3[6]
  • ARF4[6]
  • ARF5[6][7]
  • ARL2[6][7] RAS-Superfamilie
  • CSF1[6] Koloniestimulierender Faktor, gering exprimiert
  • CSK C-src tyrosine kinase[6]
  • DCT[6][7] Dopachrom-Tautomerase
  • EFNA3[6]
  • FKBP1A[6][7]
  • GDI1[6] GDI-Dissoziationsinhibitor (Rab-Familie)
  • GNAS1[6] ubiquitär exprimiert, aber differentielles Imprinting
  • GNAI2[6][7]
  • HAX1[6][7] assoziiert mit Tyrosinkinasen
  • ILK[6] Integrin linked kinase
  • MAPKAPK2[6]
  • MAP2K2[6][7]
  • MAP3K11[6]
  • PITPNM[6] Phosphatidylinositol-Transfer-Proteine
  • RAC1[6][7] Rho-GTPase
  • RAP1B[6][7] GTPase, beteiligt an der Zelladhäsion
  • RAGA[6][7] Ras-verwandtes GTP-bindendes Protein
  • STK19[6]
  • STK24[6] Serin/Threonin-Kinase
  • STK25[7]
  • YWHAB[6][7] Tyrosin-3-Monooxygenase/Tryptophan-5-Monooxygenase aktivierendes Protein, β-Polypeptid
  • YWHAH[6][7] Tyrosin-3-Monooxygenase/Tryptophan-5-Monooxygenase aktivierendes Protein, h-Polypeptid
  • YWHAQ[6][7] Tyrosin-3-Monooxygenase/Tryptophan-5-Monooxygenase aktivierendes Protein, θ-Polypeptid
  • YWHAZ[6][7] Tyrosin-3-Monooxygenase/Tryptophan-5-Monooxygenase aktivierendes Protein, ζ-Polypeptid

Wachstumsfaktoren

  • AIF1[6]
  • HDGF[6] Hepatom-abgeleiteter Wachstumsfaktor (transloziert zum Zellkern)
  • HGS[6]
  • LTBP4[6]
  • VEGFB[6]
  • ZFP36L1[6]

Gewebe-Nekrose-Faktoren

Caseinkinasen

Verschiedenes

  • ALAS1 δ-Aminolävulinatsynthase Typ 1 (Typ 2 ist erythroid und mit Porphyrie assoziiert)
  • ARHGEF2[6] Guanin-Nukleotid-Austauschfaktor
  • ARMET[6][7] Mesencephalere Astrozyten-abgeleiteter neurotropher Faktor
  • AES[6][7] Amino-terminal Enhancer of Split
  • BECN1[6] beteiligt an der Autophagie
  • BUD31[6] früher Maternal G10 transcript
  • Creatine kinase[6] CKB (ATP-Reservoir)
  • Cytidine deaminase[6]
  • CPNE1[6]
  • ENSA (gene)[6]
  • FTH1[6] Ferritin schwere Kette
  • GDI2[6] rab/ras vesikulärer Transport
  • GUK1[6][7] Guanylatkinase
  • HPRT[6][8] Hypoxanthin-Guanin-Phosphoribosyltransferase
  • IFITM1[6] Induced by interferon, transmembrane protein
  • JTB (gene)[6][7] Jumping translocation breakpoint
  • MMPL2[6]
  • NME2[6][7] (früher NM23B) Nukleosid-Diphosphat-Kinase
  • NONO[6]
  • P4HB[6][7]
  • PRDX1[6] Peroxiredoxin (reduziert Peroxide)
  • PTMA[6] Prothymosin
  • RPA2[6] Bindet DNA während der Replikation und streckt sie
  • SULT1A3[6] Sulfotransferase
  • SYNGR2[6][7] Synaptogyrin (nimmt möglicherweise an der Vesikeltranslokation teil)
  • Tetratricopeptide, TTC1[6] small glutamine rich tetratricopeptide

Offene Leseraster

Begrenzt auf Spermien oder Hoden

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Einzelnachweise

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