Der Arapja-Gletscher ist ein 11,4 km langer und 5 km breiter Gletscher im westantarktischen Ellsworthland. Er fließt östlich des Chapman Peak südwärts entlang des Gebirgskamms Barnes Ridge und mündet südwestlich des Mount Besch und südlich des Young-Gletschers auf der Ostseite des nordzentralen Teils der Sentinel Range des Ellsworthgebirges in den Ellen-Gletscher.