Chatonnay war eine französische Gemeinde mit zuletzt 65 Einwohnern im Département Jura in der Region Bourgogne-Franche-Comté. Sie gehörte zum Arrondissement Lons-le-Saunier und zum Kanton Moirans-en-Montagne. Chatonnay ist ein Ortsteil der Gemeinde Valzin en Petite Montagne.