Anexo:Cuartos de final del Torneo Apertura 2020 (El Salvador)
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Para la última fase del Apertura 2020, los Cuartos de final, clasificaron los mejores cuatro ubicados en las tablas de la fase hexagonal. Estos ocho equipos se dividieron en cuatro llaves: llave A, B, C y D. Se jugaron partidos a ida y vuelta, sin tener en cuenta regla de gol de visitante; los ubicados del primer (1°) al cuarto (4°) puesto de cada grupo jugarán el partido de vuelta en condición de locales. En caso de empate en puntos y goles al final de los dos partidos, se definirá al equipo clasificado a la siguiente fase por medio de una tanda de penales, sin prórroga previa.