La Misión San Juan Capistrano es una parroquia católica, ubicada en la localidad de San Juan Capistrano, California, Estados Unidos. Fue erigida por el Padre Presidente de las misiones de Alta California, fray Junípero Serra, el año 1776. Es considerada un Hito Histórico Nacional y probablemente la más reconocida de las misiones californianas. Asimismo, contiene el edificio más antiguo en uso de California.