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Cet article traite de la faune des Pyrénées, particulièrement des espèces sauvages endémiques et des espèces ou races domestiques originaires de cette chaîne montagneuse.
La faune des Pyrénées présente plusieurs exemples saisissants d'endémisme : Le Desman des Pyrénées peut être trouvé seulement dans certains cours d'eau et versants du nord de la chaîne, seul une autre espèce appartenant au même genre étant confinée aux fleuves du Caucase, dans la Russie méridionale. L'euprocte des Pyrénées (Calotriton asper), un cousin endémique de la salamandre, vit également dans les cours d'eau et les lacs situés aux altitudes élevées. Parmi les autres particularités de la faune pyrénéenne sont les insectes aveugles des cavernes de l'Ariège, les principaux genres étant l'Anophthalmus et l'Adelops.
Le Bouquetin des Pyrénées s'est éteint en , quant à l'ours brun indigène des Pyrénées, il a été chassé jusqu'à sa quasi-extinction dans les années 90, on tente depuis 1996 de sauvegarder l'espèce avec la réintroduction d'ours apportés de Slovénie.
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