From Wikipedia, the free encyclopedia
Os/as pseudoencimas ou pseudoenzimas son variantes de encimas que son cataliticamente deficientes (xeralmente inactivos), o que significa que realizan pouca ou ningunha catálise encimática. Crese que existen en todas as grandes familias de encimas en todos os reinos da vida. Os pseudoencimas están sendo cada vez máis importantes á hora de analizar a actividade celular, especialmente a medida que a análise bioinformática dos xenomas revela a súa omnipresenza. As súas importantes funcións reguladoras e ás veces as asociadas con doenzas nas vías de sinalización celular e metabólicas están proporcionando unha nova visión sobre as funcións non catalíticas dos encimas activos (o pluriemprego de proteínas ou protein moonlighting), e suxeríronse novas vías para abordar e interpretar os mecanismos de sinalización celular usando pequenas moléculas e fármacos.[1] Os pseudoencimas que foron máis analizados e os mellor coñecidos en canto ás súas funcións de sinalización celular son probablemente as pseudoquinases, as pseudoproteases e as pseudofosfatases.
Detectouse a diferenza entre homólogos encimaticamente activos ou inactivos ás veces a nivel de secuencia (e en certos casos, comprendeuse isto cando se comparaban proteínas activas e inactivas de familias recoñecidas).[2] e algúns pseudoencimas analizados en protozoos parasitos foron denominados 'procimas' ou 'prozimas'.[3] Os pseudoencimas mellor estudados pertencen a varias superfamilias de encimas claves na sinalización celular, como as proteases,[4] as proteína quinases,[5][6][7][8][9][10] proteína fosfatases [8][11] e encimas modificantes de ubiquitina.[12][13] Recoñeceuse tamén o papel dos pseudoencimas como "pseudoarmazóns" [14] e a bioloxía e función dos pseudoencimas están agora empezando a ser estudadas máis a fondo, en gran parte porque son tamén interesantes dianas potenciais (ou antidianas) para o deseño de fármacos no contexto dos complexos de sinalización celular intracelular.[15][16]
Clase | Función | Exemplos [17] |
---|---|---|
Pseudoquinase | Regulación alostérica das proteína quinases convencionais | STRADα regula a actividade da proteína quinase convencional LKB1.
Os dominios das tirosina quinases C-terminais JAK1-3 e TYK2 son regulados polo seu dominio pseudoquinase adxacente. KSR1/2 regule a activación da proteína quinase convencional Raf |
Regulación alostérica doutros encimas | VRK3 regula a actividade da fosfatase VHR | |
Pseudo-Histidina quinase | Dominio de interacción con proteínas | A DivL de Caulobacter únese ao regulador da resposta fosforilado DivK, o que permite que DivL regula negativamente a quinase reguladora da división celular asimétrica CckA |
Pseudofosfatase | Oclusión do acceso da fosfatase convencional ao substrato | EGG-4/EGG-5 únese ao bucle de activación fosforilado da quinase MBK-2
STYX compite con DUSP4 por unirse a ERK1/2 |
Regulación alostérica de fosfatases convencionais | MTMR13 únese e promove a actividade da lípido fosfatase de MTMR2 | |
Regulación da localización de proteínas na célula | STYX actúa como unha áncora nuclear para ERK1/2 | |
Regulación da ensmblaxe do complexo de sinalización | STYX únese á proteína de caixa F FBXW7, para inhibir ao seu recrutamento no complexo SCF ubiquitina ligase | |
Pseudoprotease | Regulador alostérico de protease convencional | cFLIP únese e inhibe a cisteína protease caspase-8 para bloquear a apoptose extrínseca |
Regulación da localización de proteínas na célula | As proteínas iRhom de mamíferos únense e regulan o tráfico das proteínas transmembrana de paso simple á membrana plasmática ou a vía de degradación asociada ao RE | |
Pseudodeubiquitinase (pseudoDUB) | Regulador alostérico da DUB convencional | KIAA0157 é esencial para a ensamblaxe dun heterotetrámero de orde maior con DUB, BRCC36 e a actividade de DUB |
Pseudoligase (pseudo-Ubiquitina E2) | Regulador alostérico da E2 ligase convencional | Mms2 é unha variante de ubiquitina E2 (UEV) que se une á E2 activa Ubc13, para dirixir ligazóns de K63 ubiquitina |
Regulación da localización de proteínas na célula | Tsg101 é un compoñente do complexo de tráfico de moléculas ESCRT-I, e xoga un papel clave na unión da proteína Gag do VIH-1 e da evaxinación do VIH | |
Pseudoligase (pseudo-Ubiquitina E3) | Posible regulador alostérico da familia RBR de E3 ligases convencionais | BRcat regula a arquitectura interdominio na familia RBR de E3 Ubiquitina ligases, como a parkina e Ariadne-1/2 |
Pseudonuclease | Regulador alostérico de nuclease convencional | CPSF-100 é un compoñente do complexo de procesamento do extremo 3' do pre-ARNm que contén o homólogo activo CPSF-73 |
PseudoATPase | Regulador alostérico de ATPase convencional | EccC comprende dous dominios pseudoATPase que regulan o dominio ATPase N-terminal convencional |
PseudoGTPase | Regulador alostérico de GTPase convencional | O Rnd1 ou Rnd3/RhoE unidos a GTP únense a p190RhoGAP para regular a actividade catalítica da GTPase convencional RhoA |
Armazón para a ensamblaxe de complexos de sinalización | MiD51, que está cataliticamente morto pero únese a GDP ou ADP, forma parte dun complexo que recruta Drp1 para mediar na fisión mitocondrial. CENP-M non pode unirse a GTP ou cambiar conformacións, mais é esencial para nuclear o complexo CENP-I, CENP-H, CENP-K GTPase pequena para regular a enamblaxe do cinetocoro | |
Regulación da localización de proteínas na célula | O dominio intermedio lixeiro de lévedo (LIC) é unha pseudoGTPase dedicada á unión a nucleótidos, que une a proteína motora dineína ao seu cargamento. O LIC humano ten preferencia por unirse a GDP antes que a GTP, o que suxire que a unión a nucleótidos podería darlle estabilidade en vez de intervir nun mecanismo de cambio conformacional. | |
Pseudoquitinase | Recrutamento ou secuestro de substrato | YKL-39 únese, pero non procesa, a quitooligosaccáridos por medio de 5 subsitios de unión |
Pseudosialidase | Armazón para a ensamblaxe de complexos de sinalización | CyRPA nuclea a ensamblaxe do complexo PfRh5/PfRipr de Plasmodium falciparum que se une ao receptor do eritrocito basixina e media na invasión da célula hóspede |
Pseudoliase | A activación alostérica de homólogos de encimas convencionais | A heterodimerización de procimas con S-adenosilmetionina descarboxilase (AdoMetDC) activa a actividade catalítica multiplicándoa por mil |
Pseudotransferase | Activación alostérica de homólogos de encimas celulares | O GAT viral recruta o PFAS celular para desaminar RIG-I e contrarrestar a defensa antiviral do hóspede. O parálogo morto da desoxihipusina sintase (TbDHS), DHSp, de Trypanosoma brucei únese e activa DHSc, cuxa actividade aumenta >1000 veces. |
Pseudo-histona acetil transferase (pseudoHAT) | Posible armazón para a ensamblaxe de complexos de sinalización | A O-GlcNAcase humana (OGA) carece de reisudos catalíticos e da unión a acetil-CoA, a diferenza do seu equivalente bacteriano |
Pseudo-fosfolipase | Posible armazón para a ensamblaxe de complexos de sinalización | A familia de proteínas FAM83 suponse que adquiriu novas funcións con preferencia á actividade catalítica ancestral de fosfolipase D |
Inactivación alostérica do homólogo encimático convencional | O inhibidor da fosfolipase A2 de víbora ensámblase estruturalmente á proteína celular humana que é a súa diana, a fosfolipase A2. | |
Pseudo-oxidorredutase | Inactivación alostérica do homólogo de encima convencional | A ALDH2*2 impide a ensamblaxe do seu homólogo activo, a ALDH2*1, para formar un tetrámero. |
Pseudo-dismutase | Activación alostérica do homólogo de encima convencional | A chaperona de cobre para a superóxido dismutase (CCS) únese e activa a catálise polo seu homólogo encimático, o SOD1 |
Pseudo-dihidroorotase | Regula o pregamento ou ensamblaxe do complexo de encima convencional | A pDHO de Pseudomonas é necesaria para pregar a subunidade catalítica da aspartato transcarbamoilase ou a súa ensamblaxe nun oligómero activo |
Pseudo-RNase | Facilita a ensamblaxe/estabilidade do complexo e promove a asociación do parálogo catalítico | KREPB4 pode actuar como pseudoencima para formar a metade non catalítica do heterodímero RNase III coa(s) endonuclease(s) editoras[18] |
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.