Bacteroidetes

As Bacteroidetes (sinónimo Bacteroidota) son un filo de bacterias composto por tres grandes clases de bacterias gramnegativas, non formadoras de esporas, anaeróbicas, e con forma de bacilos, que están amplamente distribuídas no ambiente, e que aarecen no solo, sedimentos, mares e nos intestinos e pel dos animais.

Bacteroidetes
Cultivo de Bacteroides sp..
Clasificación científica
Dominio: Bacteria Filo: Bacteroidetes
Clases
Bifissio spartinae ♠ Xin & Zhou 2001 ‘Candidatus Amoebophilus’Horn et al. 2001 ‘Candidatus Cardinium’ Zchori-Fein et al. 2004 ‘Candidatus Paenicardinium’ Noel and Atibalentja 2006 Toxothrix ♪ Molisch 1925 Venteria ♠ Bae 2005 Bacteroidia Krieg 2012 Bacteroidales Krieg 2012 ‘Candidatus Armantifilum’ Desai et al. 2010 ‘Candidatus Azobacteroides’ ‘Candidatus Symbiothrix’ Hongoh et al. 2007 ‘Candidatus Vestibaculum’ Stingl et al. 2004 Sunxiuqinia Qu et al. 2011 Bacteroidaceae Pribram 1933 Marinilabiaceae Ludwig et al. 2012 Porphyromonadaceae Krieg 2012 Prevotellaceae Krieg 2012 Rikenellaceae Krieg et al. 2012 Cytophagia Nakagawa 2012 Cytophagales Leadbetter 1974 Cyclobacteriaceae Nedashkovskaya and Ludwig 2012 Cytophagaceae Stanier 1940 Flammeovirgaceae Yoon et al. 2011 Rhodothermaceae Ludwig et al. 2012 Flavobacteriia Bernardet 2012 Flavobacteriales Bernardet 2012 Blattabacteriaceae Kambhampati 2012 Cryomorphaceae Bowman et al. 2003 Flavobacteriaceae Reichenbach et al. 1992 emend. Bernardet et al. 2002 Schleiferiaceae Albuquerque et al. 2011 Sphingobacteria Kämpfer 2012 Sphingobacteriales Kämpfer 2012 Chitinophagaceae Kämpfer et al. 2011 Saprospiraceae Krieg et al. 2012 Sphingobacteriaceae Steyn et al. 1998

Con diferenza, a clase Bacteroidia é a mellor estudada deste filo, e inclúe os xéneros Bacteroides (un organismo abundante nas feces dos animais de sangue quente, incluídos os humanos), e Porphyromonas, que habitan na cavidade bucal humana. A clase actual Bacteroidia antes foi chamada formalmente Bacteroidetes xa que ata hai pouco era a única clase do filo (nese caso coinciden os nomes do filo e a clase), pero o nome foi cambiado no cuarto volume do Bergey's Manual of Systematic Bacteriology.^[1]

Membros do xénero Bacteroides son patóxenos oportunistas. Os membros das outras dúas clases raramente son patóxenos para os humanos.

O investigador Jeffrey Gordon e os seus colegas descubriron que os homes e os rtos obesos tiñan unha flora intestinal cunha baixa porcentaxe de Bacteroidetes e relativamente maior cantidade de bacterias do grupo Firmicutes. Porén, non están seguros se os Bacteroidetes preveñen a obesidade ou se esta flora intestinal é simplemente seleccionada preferencialmente nas condicións intestinais dos que non están obesos.^[2][3][4]

Este filo agrúpase ás veces con Chlorobi, Fibrobacteres, Gemmatimonadetes, Caldithrix e o grupo mariño A para formar o grupo FCB ou superfilo. Na clasificación alternativa proposta por Cavalier-Smith, este taxon é unha clase do filo Sphingobacteria.

Filoxenia

Véxase tamén: Taxonomía bacteriana.

No cladograma móstrase a toxonomía actualmente aceptada do grupo baseada na LPSN (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature) ^[5] e no NCBI (National Center for Biotechnology Information) ^[6] e a filoxenia está baseada en datos do ARNr 16S do LTP 106 do Proxecto The All-Species Living Tree.^[7]

?Bifissio spartinae ♠ Xin & Zhou 2001     ?‘Candidatus Amoebophilus asiaticus’Horn et al. 2001     ?‘Candidatus Cardinium hertigii’ Zchori-Fein et al. 2004     ?‘Candidatus Paenicardinium endonii’ Noel e Atibalentja 2006     ?Toxothrix trichogenes ♪ (Cholodny 1924) Beger 1953     ?Venteria marina ♠ Bae 2005     Rhodothermaceae       Balneola-Gracilimonas clade       Thermonema clade       Flammeovirgaceae       Cytophagales   Reichenbachiella Nedashkovskaya et al. 2005 emend. Cha et al. 2011       Flammeovirgaceae 2 [incl. Ekhidna lutea]       Marivirga Nedashkovskaya et al. 2010       Cyclobacteriaceae [incl. Rhodonellum psychrophilum]     Cytophagaceae                 Saprospiraceae     Chitinophagaceae         Sphingobacteriaceae       Flavobacteriales   ?'Candidatus Sulcia muelleri' Moran et al. 2005     ?'Candidatus Uzinura diaspidicola' Gruwell et al. 2007     ?Schleiferia thermophila Albuquerque et al. 2011 {Schleiferiaceae}     ?Blattabacteriaceae     Cryomorphaceae 2     Flavobacteriaceae         Cryomorphaceae 1     Bacteroidales   ?‘Candidatus Armantifilum devescovinae’ Desai et al. 2010     ?‘Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae’     ?‘Candidatus Symbiothrix dinenymphae’ Hongoh et al. 2007     ?‘Candidatus Vestibaculum illigatum’ Stingl et al. 2004     ?Marinilabilia salmonicolor (Veldkamp 1961) Nakagawa e Yamasato 1996 emend. Suzuki et al. 1999     ?Sunxiuqinia elliptica Qu et al. 2011         Meniscus glaucopis Irgens 1977     Prolixibacter bellariavorans Holmes et al. 2007       Rikenellaceae           Cytophaga fermentans Bachmann 1955     Marinifilum fragile Na et al. 2009         Alkaliflexus imshenetskii Zhilina et al. 2005       Anaerophaga thermohalophila Denger et al. 2002       Porphyromonadaceae 2       Porphyromonadaceae 3       Porphyromonadaceae 1       Porphyromonadaceae 4       Porphyromonadaceae 5     Bacteroidaceae [incl. Prevotellaceae]

Notas
♠ Liñaxes atopadas no NCBI pero non na LPSN.
♪ Procariotas dos que non hai cultivos puros (axénicos) illados ou dispoñibles, porque non se poden cultivar ou duran pouco.