UniProt adalah sebuah pangkalan data urutan protein dan informasi fungsional akses-bebas, dengan banyak entri yang berasal dari proyek-proyek pengurutan genom. Pangkalan data ini mengandung sejumlah besar informasi mengenai fungsi biologis suatu protein yang diambil dari literatur-literatur penelitian. UniProt dikelola oleh konsortium UniProt, yang terdiri dari beberapa organisasi bioinformatika Eropa dan sebuah yayasan dari Washington, D.C., Amerika Serikat.
Fakta Singkat Konten, Deskripsi ...
UniProt|
Deskripsi | UniProt adalah sumber Protein Universal, sebuah repositori terpusat untuk data protein yang diciptakan dengan menggabungkan pangkalan-pangkalan data Swiss-Prot, TrEMBL dan PIR-PSD. (diterjemahkan dari bahasa Inggris) |
---|
Jenis data | Anotasi protein |
---|
Organisme | Semua |
---|
|
Pusat penelitian | EMBL-EBI, UK; SIB, Switzerland; PIR, AS. |
---|
|
Format data | Custom flat file, FASTA, GFF, RDF, XML. |
---|
Situs web | www.uniprot.org www.uniprot.org/news/ |
---|
URL pengunduhan | www.uniprot.org/downloads dan untuk menggunggah set data lengkap ftp.uniprot.org |
---|
URL layanan web | Ya – JAVA API lihat informasi disini & REST lihat informasi disini |
---|
|
Web | Pencarian lanjut, BLAST, ClustalO, pengunduhan massal, pemetaan ID |
---|
|
Lisensi | Creative Commons Attribution-NoDerivs |
---|
Versi | Ya |
---|
Frekuensi rilis data | 8 pekan |
---|
Kebijakan kurasi | Ya – manual dan otomatis. Aturan untuk anotasi otomatis dihasilkan oleh kurator pangkalan data dan alogritma komputasional. |
---|
Entitas tertandai | Ya – baik untuk pencarian maupun entri protein individual |
---|
Tutup