Entrez

L'Entrez Global Query Cross-Database Search System è un sistema di ricerca integrato tra banche dati biomediche contenenti informazioni di tipo differente.

Logo di Entrez

Entrez è coordinato dal National Center for Biotechnology Information (NCBI) statunitense, parte della National Library of Medicine (NLM) (essa stessa parte dei National Institutes of Health (NIH)).

Tipi di ricerca

Entrez è un potente motore di ricerca che permette una ricerca contemporanea su differenti database biomedici.

• PubMed. Raccoglie i riferimenti agli articoli apparsi su un numero elevato di riviste scientifiche, principalmente di tipo biomedico. Contiene anche riferimenti immediati ad articoli scientifici ad accesso libero.
• PubMed Central. Raccoglie articoli scientifici ad accesso libero.
• Bookshelf. Raccoglie libri di testo di argomenti biomedici ad accesso libero.
• OMIM. Cataloga tutte le patologie umane aventi una componente genetica.
• OMIA. Cataloga tutte le patologie animali aventi una componente genetica.
• Nucleotide. Banca dati di sequenza nucleotidica (GenBank).
• Protein. Banca dati di sequenza proteica.
• Genome. Raccoglie sequenze genomiche complete.
• Structure. Contiene strutture tridimensionali di macromolecole.
• Taxonomy. Cataloga gli organismi secondo la classificazione scientifica.
• SNP. Raccoglie gli SNPs (single nucleotide polymorphisms).
• Gene. Raccoglie informazioni di sequenza centrate sui singoli geni.
• HomoloGene. Classifica i geni a seconda dell'omologia tra differenti specie.
• PubChem Compound. Raccoglie informazioni sulle strutture chimiche di piccole molecole chimiche.
• PubChem Substance. Raccoglie dati depositati su molecole chimiche.
• Genome Project. Informazioni sui progetti genoma in corso.
• CDD. Contiene un database con i domini conservati delle proteine.
• 3D Domains. Contiene domini provenienti da Entrez Structure.
• UniSTS. Raccoglie dati di marcatura e mappatura.
• PopSet. Cataloga dati relativi a studi sulla popolazione (epidemiologia).
• Cancer Chromosomes: database citogenetici
• PubChem BioAssay: vaglio dell'attività biologica di sostanze chimiche
• GENSAT: atlante dell'espressione genica nel sistema nervoso del topo
• Probe: sequenza specifica di reagenti

Il sistema Entrez può mostrare visuali delle sequenze di geni e proteine e mappe cromosomiche. Entrez può efficientemente richiamare le sequenze, strutture e le referenze relative. Alcuni libri di testo sono anche disponibili online grazie al sistema Entrez. Entrez Global Query è un motore di ricerca integrato che fornisce accesso a tutti i database contemporaneamente.

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• Wikimedia Commons

• Wikimedia Commons contiene immagini o altri file su Entrez

Collegamenti esterni

• (EN) Homepage di Entrez, su ncbi.nlm.nih.gov.

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