自由教会、(じゆうきょうかい、Free church)とは、国教会に対し、教会の自立を確保した教会。日本のプロテスタントは、おもに自由教会の宣教師によって伝えられたものである。
自由主義神学(リベラリズム)とは関係が無い。リベラルは教会を国家から分離しようとは願わないとされる[1]。
国教会が強制的に徴収された十分の一税で運営されるのに対し、自由教会では信徒が自発的に献げる自由献金(礼拝献金、什一献金)に支えられている。自由教会の自由献金は神に対する感謝の応答としての献金であり、「自由の象徴」である[2]。