ミトコンドリアDNAハプログループ

命名法

ヒトのミトコンドリアDNAハプログループの体系は、ネイティブ・アメリカンの研究でA, B, C, Dの4つが命名された^[1]^[2]ことに始まっており、それを踏襲してラテンアルファベットの大文字で大分類を行っている。それぞれの内部は1～2ケタの数字を使って細分されており、その内部は小文字のアルファベットで細分されている。以降、必要に応じて数字と小文字を交互に用い、たとえばD5a2a1a1aという具合である^[3]。

ハプログループの命名はなるべく系統関係を階層的に反映するようにされているが、歴史的経緯により例外が多数存在している。とくに最初のアルファベットは入れ子になっているものが多く、例えばハプログループCはハプログループMに内包されているし、ハプログループMはハプログループL3に内包されている^[3]。

最初のアルファベットが連続している場合は、それら全てのハプログループを内包する最小の単系統群を意味する。たとえばHVには、少なくともハプログループHとハプログループVが含まれることを意味している。ここにはこの2つ以外にも様々な系統が含まれており、それらはHV1やHV2などのように命名されている^[3]。

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系統樹

人類のmtDNAハプログループの大まかな系統樹^[4]を示す。

L (ミトコンドリア・イヴ) - 20万年前
- L0 - アフリカ東部、15万年前
- L1-L6 - アフリカ東部、17万年前
  - L1 - アフリカ中央部、14万年前
  - L2-L6 - アフリカ東部、15万年前
    - L2 - 9万年前
    - L5 - 12万年前
    - L3,L4,L6 - 13万年前
      - L6
      - L3,L4
        L4
        
        L3 - アフリカ東部、7万年前
        M - アフリカ東部 or 西アジア or 南アジア、6万年前
        M7: M7a,M7b,M7c
        
        M8: CZ (C, Z)
        
        M9: E
        
        M12: G
        
        M29: Q
        
        D
        
        N - アフリカ東部 or 西アジア、7万年前
        N1: I - 2.6万年前
        
        N2: W - 2万年前
        
        N9: Y
        
        A
        
        S
        
        X - 3万年前
        
        O
        
        R - 6万年前
        R0 (FMKA pre-HV)
        HV - 西アジア、2.7万年前
        H - アジア西部、2万年前
        
        V - 1.4万年前
        
        pre-JT or R2、JT - 中東、5.5万年前
        JT - 中東、5万年前
        J - 3.5万年前
        
        T - メソポタミア、2.7万年前
        
        R9 - 4.7万年前
        F - 4.3万年前
        
        R11
        B - 4.4万年前（B4）
        
        P
        
        U (formerly UK) - アフリカ北西部 or 南アジア、5.5万年前
        U8 - アジア西部、5万年前
        K - 3万年前

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系統樹

脚注

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