常在菌

常在菌（じょうざいきん）は、植物や動物の体の様々な場所に存在する多種多様な微生物（細菌）のうち、種の多くに共通してみられ、病原性を示さないものを指す。細菌が集団をなしていることから、常在菌叢^[1]、常在細菌叢^[2]、あるいは正常細菌叢とも言う^[3]。

どのような常在菌がどの程度存在するかについては、地域、環境や生活習慣、身体の部位により多様である。誤解されやすいが、「健康な身体にも存在する菌」であって、「全ての個体が持っている菌」という意味ではない。

通常は個体の健康に著しい影響は与えず、あるものは共生関係にあるが、免疫力の低下などにより日和見感染を起こすこともある。

また、常在菌が存在することにより、病原性微生物の感染を抑制する影響もあると考えられている。抗生物質の使用などにより常在菌が極端に減少すると、他の病原性微生物などが増殖する菌交代症が起こることがある。

ヒトの場合、外界と接することのない体腔は無菌状態であるが、外界と接する場所には各種の菌が存在する^[2]。常在菌が最も多く存在するのは腸管内で、その細胞数は体細胞全体のそれを超えると考えられている。その他、口腔・鼻腔内や生殖器、あるいは皮膚全域に、数百種類が互いに影響しながら常在している。

特に腸内細菌のバランス細菌叢のコントロールについては、生活習慣病などを予防する手段として健康食品 プロバイオティクスをはじめとする多様な考えが提案されている。