Sp1転写因子

Sp1転写因子（specificity protein 1）は、ヒトではSP1遺伝子によってコードされるタンパク質である^[5]。

SP1
PDBに登録されている構造 PDB オルソログ検索: RCSB PDBe PDBj PDBのIDコード一覧 1SP1, 1SP2, 1VA1, 1VA2, 1VA3
識別子
記号	SP1, entrez:6667, Sp1 transcription factor
外部ID	OMIM: 189906 MGI: 98372 HomoloGene: 8276 GeneCards: SP1
遺伝子の位置 (ヒト) 染色体 12番染色体 (ヒト)[1] バンド データ無し 開始点 53,380,176 bp[1] 終点 53,416,446 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス) 染色体 15番染色体 (マウス)[2] バンド データ無し 開始点 102,314,578 bp[2] 終点 102,344,839 bp[2]
RNA発現パターン さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 • protein homodimerization activity • HMG box domain binding • 転写因子結合 • ヒストンデアセチラーゼ結合 • 金属イオン結合 • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • bHLH transcription factor binding • protein C-terminus binding • 血漿タンパク結合 • histone acetyltransferase binding • 核酸結合 • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA結合 • 二本鎖DNA結合 • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA-binding transcription factor activity • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • core promoter sequence-specific DNA binding • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • cis-regulatory region sequence-specific DNA binding 細胞の構成要素 • 細胞質 • 核質 • protein-DNA complex • 細胞核 • transcription repressor complex 生物学的プロセス • positive regulation of hydrogen sulfide biosynthetic process • 周期的プロセス • regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of transcription, DNA-templated • viral process • regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase II • cellular response to insulin stimulus • positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of cholesterol biosynthetic process • positive regulation of gene expression • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration • positive regulation of angiogenesis • positive regulation of vascular endothelial cell proliferation • ヒドロペルオキシドへの反応 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
種	ヒト	マウス
Entrez	6667	20683
Ensembl	ENSG00000185591	ENSMUSG00000001280
UniProt	P08047	O89090
RefSeq (mRNA)	NM_001251825 NM_003109 NM_138473	NM_013672
RefSeq (タンパク質)	NP_001238754 NP_003100 NP_612482	NP_038700
場所 (UCSC)	Chr 12: 53.38 – 53.42 Mb	Chr 12: 102.31 – 102.34 Mb
PubMed検索	[3]	[4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト 閲覧/編集 マウス

機能

SP1遺伝子にコードされるSP1タンパク質はジンクフィンガー型転写因子であり、多くのプロモーターのGCリッチモチーフに結合する。SP1タンパク質は、細胞分化、細胞成長、アポトーシス、免疫応答、DNA損傷応答、クロマチンリモデリングなど多くの細胞過程に関与している。このタンパク質の活性はリン酸化、アセチル化、グリコシル化などの翻訳後修飾やタンパク質分解によるプロセシングの影響を受け、アクチベーターとしてもリプレッサーとしても機能する^[5]。

ミトコンドリアフェリチン遺伝子（FTMT）の推定プロモーター領域に結合する転写の正の調節因子としてSP1、CREB、YY1が、負の調節因子としてGATA2（英語版）、FOXA1（英語版）、C/EBPβ（英語版）が同定されている^[6]。これらの調節因子のDNA結合活性に対するデフェリプロン（英語版）（DFP）の影響がクロマチン免疫沈降（ChIP）アッセイによって調べられている。これらの中で、SP1のみがDFP処理後に用量依存的なDNA結合活性の大幅な増大を示した。siRNAによるSP1のノックダウンによってDFPによるFTMTのｍRNAレベルの増加はみられなくなることから、DFPの存在下ではSP1を介したFTMTの発現の調節が行われていることが示唆される。DFP処理はSP1の細胞質および核内での発現を増加させ、主に核内に局在させる^[7]。

構造

SP1は転写因子のSp/KLFファミリー（英語版）に属し、785アミノ酸長、81 kDaである。SP1転写因子はジンクフィンガーモチーフをもち、これを介してDNAに直接結合して遺伝子の転写を亢進させる。ジンクフィンガーはCys₂/His₂型で、5'-(G/T)GGGCGG(G/A)(G/A)(C/T)-3'のコンセンサス配列（GCボックス（英語版）エレメント）に結合する。ヒトゲノム中には12,000か所程度のSP1結合部位が見つかっている^[8]。

応用

Sp1は芳香族炭化水素受容体やエストロゲン受容体の双方に結合し、そして比較的一定のレベルで存在するため、これらの受容体の増加や減少の研究の際のコントロールタンパク質として利用される^[9]。

阻害剤

Streptomyces plicatus（英語版）によって産生される抗腫瘍性抗生物質であるプリカマイシン（英語版）や、アシュワガンダWithania somnifera由来のステロイドラクトンであるウィザフェリンA（英語版）はSp1転写因子を阻害することが知られている^[10][11]。

miR-375-5pは大腸がん細胞でSP1とYAP1の発現を大きく低下させる。SP1とYAP1のｍRNAはmiR-375-5pの直接的な標的である^[12]。

相互作用

Sp1転写因子は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。

• AATF（英語版）^[13]
• CEBPB（英語版）^[14][15]
• COL1A1（英語版）^[16]
• E2F1（英語版）^[17][18][19]
• FOSL1（英語版）^[20]
• GABPA（英語版）^[21]
• HDAC1（英語版）^{[13][22][23][24]}
• HDAC2（英語版）^[23][24][25]
• HMGA1（英語版）^[15]
• HCFC1（英語版）^[26][27]
• HTT^[28]
• KLF6（英語版）^[29]
• MEF2C（英語版）^[30]
• MEF2D（英語版）^[31]
• MSX1（英語版）^[32]
• MYOG（英語版）^[33]
• POU2F1（英語版）^[26][34]
• PPP1R13L（英語版）^[35]
• PSMC5（英語版）^[36][37]
• PML^[38]
• RELA（英語版）^[39][40]
• SMAD3^[41][42]
• SUMO1（英語版）^[36]
• SF1（英語版）^[43]
• TAL1（英語版）^[44]
• UBC（英語版）^[36]
• WRN^[45]