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하플로그룹 R은 인류 미토콘드리아 DNA 하플로그룹의 일종이다. 사하라 이남 아프리카를 제외한 모든 지역에 널리 분포하며, 남부 경로 대확장이 일어나고 얼마 지나지 않은 약 65,000년 전에 하플로그룹 N에서 일찍이 분기되어 나와 호모 사피엔스 인구가 유라시아로 빠르게 확장함과 동반하여 퍼진 것으로 보인다.
모계 하플로그룹 R 및 그 파생 그룹들은 지역별로 차이는 있으나 유라시아, 아메리카, 오스트레일리아, 북아프리카, 동북아프리카의 각지에 걸쳐 넓게 분포한다.
특히 남아시아의 원주민들에게서 분기가 오래되고 조밀하게 나타난다는 점에서 초기 발생 당시 남아시아에서 동남아시아에 걸친 해안 지역을 거친 후 확장했을 가능성이 제시된다. 최근공통조상 연구 등을 통한 추정치로는 하플로그룹 L3으로부터 하플로그룹 N이 파생된지 오래 지나지 않아 R이 발생하였는데, L3에서 하플로그룹 M이 파생된 시기보다도 훨씬 이른 것으로 보인다.
기저형인 R*은 소코트라섬, 동북아프리카, 중동, 근동, 아라비아 반도에서 1% 내외로 발견된다. 시베리아에서 발견된 약 45,000년 전의 유골 Ust'-Ishim man에서도 R*(구 명칭 U*)이 검출되었다.[1][2]
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