| 정부 |
대수 |
이름 |
임기 |
비고 |
| 김대중 정부 |
초대 |
한완상(韓完相) |
2001년 1월 29일 ~ 2002년 1월 28일 |
상지대 총장&한성대 총장&통일부총리&경제정의실천시민연합 이사장&대한적십자사 총재 |
| 2대 |
이상주(李相周) |
2002년 1월 29일 ~ 2003년 3월 6일 |
서울대 교수&강원대 총장&울산대 총장&대통령비서실 교육문화수석비서관&대통령비서실장&한국정신문화연구원장 |
| 노무현 정부 |
3대 |
윤덕홍(尹德弘) |
2003년 3월 7일 ~ 2003년 12월 23일 |
대구대 총장&한국학중앙연구원장&민주당 최고위원 |
| 4대 |
안병영(安秉永) |
2003년 12월 24일 ~ 2005년 1월 4일 |
연세대 교수&한국사회과학연구협의회장&아시아사회과학연구협의회장&한국행정학회장 |
| 5대 |
이기준(李基俊) |
2005년 1월 5일 ~ 2005년 1월 10일 |
서울대 총장&한국공학한림원장&한국산업기술재단 이사장&한국과학기술단체총연합회장 |
직무
대행 |
김영식(金永植) |
2005년 1월 11일 ~ 2005년 1월 27일 |
교육인적자원부 고등교육지원국장·기획관리실장·차관 |
| 6대 |
김진표(金振杓) |
2005년 1월 28일 ~ 2006년 7월 20일 |
대통령비서실 정책기획수석비서관&국무조정실장&경제부총리&제17·18·19대 국회의원 |
| 7대 |
김병준(金秉準) |
2006년 7월 21일 ~ 2006년 8월 8일 |
국민대 교수&대통령비서실 정책특별보좌관·정책실장&정부혁신지방분권위원회 위원장 |
직무
대행 |
이종서(李鍾瑞) |
2006년 8월 9일 ~ 2006년 9월 19일 |
교육부 교육정책기획관·고등교육지원국장&교원소청심사위원회 위원장·교육인적자원부 차관 |
| 8대 |
김신일(金信一) |
2006년 9월 20일 ~ 2008년 2월 5일 |
서울여대 교수&서울대 교수&한국사회교육협회장&한국교육학회장 |
직무
대행 |
서남수(徐南洙) |
2008년 2월 6일 ~ 2008년 2월 28일 |
위덕대 총장&교육인적자원부 차관&교육부 장관&서울장학재단 이사 |