농림축산검역본부 호남지역본부(農林畜産檢疫本部 湖南地域本部)는 농림축산검역본부의 소속기관이다. 2013년 3월 23일 발족하였으며, 전북특별자치도 군산시 미장8길 7에 위치하고 있다. 본부장은 서기관 또는 기술서기관으로 보한다.