서해어업관리단(西海漁業管理團, West Sea Fisheries Management Service)은 대한민국 해양수산부의 소속기관이다. 2011년 6월 15일 발족하였으며, 전라남도 목포시 고하대로597번길 75-68에 위치하고 있다. 단장은 서기관 또는 기술서기관으로 보한다.
