정신건강연구소(精神健康硏究所, 영어: Mental Health Research Institute)는 국립정신건강센터의 소속기관이다. 서울특별시 광진구 용마산로 127에 위치하고 있다. 소장은 부이사관·기술서기관 또는 보건연구관인 임기제공무원으로 보한다.