Klub został założony w miejscowości Pune 13 kwietnia 2014 roku^[1] po tym, jak na początku 2014 roku narodowa federacja piłki nożnej w Indiach ogłosiła powstanie Indian Super League. 13 kwietnia 2014 roku ogłoszono, że Salman Khan i Wadhawan Group wygrali przetarg na franczyzę Pune. 14 października tego samego roku klub rozegrał swój pierwszy oficjalny mecz w Superlidze, remisując 0:0 z Delhi Dynamos FC na stadionie piłkarskim Jawaharlal Nehru Stadium w Nowym Delhi. W inauguracyjnym sezonie 2014 zespół nie zdobył miejsca na podium, zajmując szóstą pozycję w tabeli ligowej i nie awansował do fazy play-off. Przez kolejne trzy sezony klub był poza czwórką najlepszych drużyn, które potem walczyły o tytuł mistrza. Dopiero w sezonie 2017/18 zajął czwarte miejsce w rundzie zasadniczej i awansował do etapu play-off, ale przegrał w półfinale.

W 2019 roku klub próbował nielegalnie pozyskać zawodnika z Chennai City FC (Hiszpana Néstora Gordillo), podczas gdy zawodnik nadal miał kontrakt z Chennai City. Indyjska Federacja Piłki Nożnej mocno uderzyła w Pune City, ponieważ nałożono na nich zakaz transferów w dwóch oknach, grzywnę w wysokości 50 lakhów i dwuletni zakaz udziału w jakichkolwiek turniejach AFC. W ciągu kilku miesięcy od incydentu klub został rozwiązany, a udziały sprzedane. Następnie nowi właściciele przenieśli bazę z Pune do południowego miasta Hyderabad jako Hyderabad FC.

Klub ma barwy pomarańczowo-fioletowe. Piłkarze domowe spotkania zazwyczaj grają w pomarańczowych koszulkach, pomarańczowych spodenkach oraz pomarańczowych getrach.

Klub piłkarski rozgrywał swoje mecze domowe na stadionie Shree Shiv Chhatrapati Sports Complex w Pune, który mógł pomieścić 9.110 widzów.

• Mumbai City FC