Гаплогруппа D (Y-ДНК)

Не следует путать с Гаплогруппа D (мтДНК).

Гаплогруппа D (CTS3946) — гаплогруппа ДНК Y-хромосомы. Как гаплогруппа D, так и E содержат однонуклеотидный полиморфизм M168, который имеется во всех гаплогруппах, кроме A и B (см. группа CT), а также полиморфизм уникального события YAP, уникальный для гаплогруппы DE — общего предка D и Е.

Гаплогруппа D
Тип	Y-ДНК
Время появления	64,7-83 тыс. лет назад[1]
Место появления	Африка, Азия[1]
Предковая группа	DE
Сестринские группы	E
Субклады	D1, D2
Мутации-маркеры	CTS3946, CTS4030/Z1605

Происхождение

Гаплогруппа D происходит от мутации Y-хромосомной гаплогруппы DE, произошедшей у мужчины, жившего предположительно 65,2 тыс. лет назад. Время жизни общего предка всех живущих носителей Y-хромосомной гаплогруппы D — 46,5 тыс. лет назад (даты определены по снипам компанией YFull^[2]).

Крис Тайлер-Смит с коллегами считают, что гаплогруппа D образовалась в Африке около 73 тыс. л. н., а около 71 тыс. лет назад отделилась западноафриканская линия D0^[1]. И гаплогруппа D, и гаплогруппа E содержат характеристику уникальный полиморфизм событий YAP, но показывают общее происхождение. Субклад гаплогруппы D1- M174 возник, с большой вероятностью в Азии, около 60 тыс. лет назад. Субклад гаплогруппы D1- M174 не встречается за пределами Азии. Гаплогруппа D2 была обнаружена незначительно в Африке и Передней Азии^[3].

По мнению Т. Карафет, гаплогруппа D возникла в Азии около 60 тыс. лет назад^[4][5].

Палеогенетика

• Гаплогруппа D обнаружена у образца Ma91 (ок. 4319 л. н.) из Малайзии^[6].
• Субклад D1a2b1 (D1b2a-CTS220 в ISOGG 2018) выявлен у представителя культуры Дзёмон, жившего примерно 3500—3800 лет назад^[7]. У образца I6341 (Burial 5, JOM_137, 1500—1000 лет до н. э., Funadomari, Ребун) определена Y-хромосомная гаплогруппа D-M174/F1344>D1b-M64.1>Z1516, у образца I13887 (1063 Burial 7, 2191—1982 лет до н. э., Rokutsu Shell Mound, Хонсю) — D1a2a3a-Z1570 (D1b1c1 в ISOGG 2018), у образца I13886 (1062 Burial 6, 2136—1959 лет до н. э., Rokutsu Shell Mound, Хонсю) — D1a2a3a-Z1575 (D1b1c1 в ISOGG 2018), у образца I13883 (1050 Burial 2, 984—835 лет до н. э., Rokutsu Shell Mound, Хонсю) — D1b-M64.1>D1b1c-CTS6609>D1b1c1-Z1574>Y11739 (ISOGG 2018)^[8].
• Гаплогруппа D1a2a1 определена у представителя кобанской культуры из могильника Заюково-3, расположенного близ села Заюково в Баксанском районе Кабардино-Балкарии (VIII—VII века до н. э.)^[9].
• D1b-M64.1>Z1516>CTS220 определили у образца I15926 (SRM 3826-1163, Pogrebeniye 2, Burial #2, 1800—1950 гг.) со стоянки Nevelsk 2 на Сахалине^[8].

Обзор

В настоящее время встречается с высокой частотой среди населения Тибета, Японского архипелага^[10] и Андаманских островов, однако, в силу неизвестных обстоятельств, пока не обнаружена на полуострове Индостан. Айны в Японии, а также народы джарава и онге на Андаманских островах имеют почти исключительно данную гаплогруппу, хотя у айнов кроме гаплогруппы D1a2 (81,3%^[11]) с частотой около 15 % также встречается Y-хромосомная гаплогруппа C3.

Также Y-хромосомная гаплогруппа D обнаружена с низкой или умеренной частотой у народов Центральной Азии и севера Восточной Азии, а также у китайцев-хань и народов мяо-яо в Китае и некоторых национальных меньшинств китайских провинций Сычуань и Юньнань, говорящих на тибето-бирманских языках и проживающих в непосредственной близости от тибетцев. Субклад D1a1a-M15, выявленный в популяции народа И (Ляншань-Ийский автономный округ) был разветвлением расширения тибетских групп с запада на восток на плато^[12].

В отличие от гаплогруппы C, гаплогруппа D не мигрировала из Азии через Берингию в Новый Свет.

Гаплогруппа D также примечательна своей исключительной географической дифференциацией, когда определённый подкласс гаплогруппы чётко локализуется в какой-либо популяции, где большой процент лиц имеют гаплогруппу D:

• гаплогруппа D1a1 среди тибетцев (а также среди жителей материковой Восточной Азии, где крайне редко встречается «родительская» гаплогруппа D),среди жителей Тибета, Таджикистана и в других горных регионах юга Центральной Азии,
• гаплогруппа D1a2 — среди различных групп населения Японского архипелага,
• гаплогруппа D1a3 — среди жителей Андаманских островов.
• гаплогруппы D* обнаружен с весьма низкой частотой среди тюркских и монгольских народов Центральной Азии, составляя не более 1 % населения.

Такая, по-видимому, древняя диверсификация гаплогруппы D заставляет предположить, что её скорее следует охарактеризовать как «супергаплогруппу», «макрогаплогруппу».

Особо характерными являются примеры гаплогруппы D у населения Японских островов, поскольку они содержат комплекс из как минимум пяти отдельных мутаций, свойственных гаплогруппе D, что ясно отличает их от гаплогруппы D, обнаруженной у жителей Тибета и Андаманских островов. Этот факт является свидетельством того, что гаплогруппа D1a2 была модальной гаплогруппой доисторической культуры Дзёмон на Японских островах.

Подклассы

Филогенетическое дерево

ISOGG (version: 14.151)^[13].

• DE (YAP)
  • D (CTS3946)
    • D1 (M174/Page30, IMS-JST021355)
      • D1a (CTS11577)　
        • D1a1 (F6251/Z27276)
          • D1a1a (M15)　Республика Алтай, Тибет^[14]
          • D1a1b (P99)　Республика Алтай, Тибет, Монголия, Туркестан^[14]
        • D1a2 (M64.1/Page44.1, M55) 　Япония^[14]
        • D1a3 (Y34637)　Андаманские острова^[15]
      • D1b (L1378) 　 Филиппины^[16]
    • D2 (A5580.2) 　Гвинея-Бисау, Нигерия^[1], Саудовская Аравия, Сирия^[3]