Пикорнавирусы

Пикорнави́русы^[2] (лат. Picornaviridae, от pico — маленький и rna — РНК) — семейство, объединяющее маленькие икосаэдрические вирусы высших позвоночных, содержащих одноцепочечную геномную РНК положительной полярности (то есть той же полярности, что и мРНК). Размер капсида составляет около 27—30 нм, размер генома — около 7—8 тысяч оснований. Размножение пикорнавирусов происходит в цитоплазме заражённой клетки. К пикорнавирусам относятся возбудители таких заболеваний, как полиомиелит, ринит, ящур, гепатит A и др. В мире вирусов пикорнавирусы выделяются очень высокой скоростью мутирования, что обуславливает высокую вероятность появления вредоносных для человека их вариантов^[3].

Пикорнавирусы
Вирус полиомиелита
Научная классификация
Группа: Вирусы[1] Реалм: Riboviria Царство: Orthornavirae Тип: Pisuviricota Класс: Pisoniviricetes Порядок: Picornavirales Семейство: Пикорнавирусы
Международное научное название
Picornaviridae
Роды
см. текст
Группа по Балтимору
IV: (+)оцРНК-вирусы
Систематика в Викивидах Изображения на Викискладе NCBI   12058 EOL   8043

Строение генома

Общая схема строения геномной РНК (A) и процессинга полипротеина пикорнавирусов (B)

Геномная РНК пикорнавирусов содержит в большинстве случаев одну открытую рамку считывания под контролем IRES — участка внутренней посадки рибосомы. Трансляция вирусной РНК приводит к образованию гигантского белка-предшественника, который ещё до завершения синтеза нарезается вирусными протеазами, с образованием зрелых вирусных белков. К 5'-концу вирусной РНК ковалентно прикреплён маленький белок — VPg (от англ. viral protein genome linked, вирусный белок, соединённый с геномом). 3'-конец полиаденилирован (содержит несколько десятков остатков аденина, подобно клеточным мРНК). На 5'- и 3'-концах вирусной РНК располагаются так называемые цис-репликативные элементы (OriL и OriR, соответственно — от англ. origin — «начало», left — «левый», right — «правый») — последовательности, необходимые для репликации генома.

Белки пикорнавирусов

Геном пикорнавирусов кодирует около десятка белков, обеспечивающих репликацию вирусной РНК, перепрограммирование клетки, сборку зрелых вирионов. Кодирующую область генома довольно условно делят на три участка: P1 — кодирует структурные белки VP1, VP2, VP3, VP4, из которых строится вирусная частица. P2 и P3 — кодируют белки, необходимые для перепрограммирования клетки и репликации:

• 2А — негомологичен у представителей разных родов пикорнавирусов. Например, у афто- и кардиовирусов — это пептид, который вызывает ко-трансляционный разрыв в синтезируемой белковой цепи полипротеина, а у энтеро- и риновирусов — сериновая протеаза.
• 2B и 3A — небольшие гидрофобные белки, принимающие участие в вызываемом пикорнавирусами изменении мембран клетки.
• 2С — этот белок имеет гомологию с хеликазами, входит в состав пикорнавирусного репликативного комплекса.
• 3B — это VPg, белок прикрепляющийся к 5'-концу вирусной РНК.
• 3С — цистеиновая протеаза, разрезающая полипротеин^[4].
• 3D — РНК-полимераза, белок синтезирующий вирусную РНК.
• L — лидерный белок также негомологичен у представителей разных родов, у ряда пикорнавирусов отсутствует. У афтовирусов он является протеазой, отщепляющей себя от полипротеина, у кардиовирусов^[англ.] и Teschovirus^[англ.] лишён энзиматической активности.

Классификация

По данным Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV), на май 2024 г. в семейство включают 68 родов^[5]:

Род	Вид (представитель)
Ailurivirus	Ailurivirus agiapa
Aphthovirus	Aphthovirus reedi
Bopivirus	Bopivirus abovi
Cardiovirus	Cardiovirus saffoldi
Cosavirus	Cosavirus depakis
Erbovirus	Erbovirus aequirhi
Hunnivirus	Hunnivirus amagyari
Malagasivirus	Malagasivirus alphalesa
Marsupivirus	Marsupivirus aburpengari
Mischivirus	Mischivirus acombewi
Mosavirus	Mosavirus betibeti
Mupivirus	Mupivirus arati
Senecavirus	Senecavirus cetus
Teschovirus	Teschovirus asilesi
Torchivirus	Torchivirus atorpi
Tottorivirus	Tottorivirus asuscro
Anativirus	Anativirus aductai
Boosepivirus	Boosepivirus atauri
Diresapivirus	Diresapivirus arhiferi
Enterovirus	Enterovirus deconjuncti
Felipivirus	Felipivirus acati
Parabovirus	Parabovirus chiwhibe
Rabovirus	Rabovirus dehomo
Sapelovirus	Sapelovirus anglia
Caecilivirus	Caecilivirus banna
Crahelivirus	Crahelivirus agapo
Fipivirus	Fipivirus besharpi
Gruhelivirus	Gruhelivirus agrusa
Hepatovirus	Hepatovirus ishrewi
Rohelivirus	Rohelivirus arodenti
Tremovirus	Tremovirus beturtli
Danipivirus	Danipivirus abrafi
Dicipivirus	Dicipivirus acadici
Gallivirus	Gallivirus afowli
Hemipivirus	Hemipivirus aholtge
Kobuvirus	Kobuvirus aichi
Livupivirus	Livupivirus asmonewi
Ludopivirus	Ludopivirus agrewhifrogo
Megrivirus	Megrivirus chigalli
Myrropivirus	Myrropivirus achiwas
Oscivirus	Oscivirus ahokorobi
Passerivirus	Passerivirus bewaxi
Pemapivirus	Pemapivirus brohepotu
Poecivirus	Poecivirus ablacachi
Pygoscepivirus	Pygoscepivirus apingu
Rafivirus	Rafivirus crhima
Rajidapivirus	Rajidapivirus ashaska
Rosavirus	Rosavirus chewhibe
Sakobuvirus	Sakobuvirus aportufeli
Salivirus	Salivirus aklasse
Sicinivirus	Sicinivirus ahiberni
Symapivirus	Symapivirus atriliza
Tropivirus	Tropivirus betero
Aalivirus	Aalivirus apekidu
Aquamavirus	Aquamavirus apinni
Avihepatovirus	Avihepatovirus ahepati
Avisivirus	Avisivirus aturki
Crohivirus	Crohivirus beidoli
Grusopivirus	Grusopivirus celori
Kunsagivirus	Kunsagivirus agrepla
Limnipivirus	Limnipivirus disploca
Orivirus	Orivirus aoroshaza
Parechovirus	Parechovirus feterobo
Pasivirus	Pasivirus agallia
Potamipivirus	Potamipivirus balaski
Shanbavirus	Shanbavirus aminfuli
Ampivirus	Ampivirus apilisi
Harkavirus	Harkavirus alfoldi

См. также

• Вирус энцефаломиелита птиц