Серин-рацемаза

Серин-рацемаза (англ. Serine racemase, SRR) — фермент, преобразующий L-серин в D-серин. D-серин служит сигнальной молекулой в мозге для NMDA-рецепторов, связываясь с их глициновым сайтом. У человека, серин-рацемаза кодируется геном SRR^[5].

Серин-рацемаза
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 3L6B, 3L6R
Идентификаторы
Псевдонимы	SRR, ILV1, ISO1, serine racemase
Внешние ID	OMIM: 606477 MGI: 1351636 HomoloGene: 22775 GeneCards: SRR
Расположение гена (человек) Хр. 17-я хромосома человека[1] Локус 17p13.3 Начало 2,303,383 bp[1] Конец 2,325,260 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 11-я хромосома мыши[2] Локус 11|11 B5 Начало 74,797,185 bp[2] Конец 74,816,774 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в ventricular zone muscle of thigh stromal cell of endometrium Наибольшая экспрессия в Region I of hippocampus proper dentate gyrus of hippocampal formation granule cell primary visual cortex left lobe of liver proximal tubule Дополнительные справочные данные BioGPS н/д
Генная онтология Молекулярная функция threonine racemase activity нуклеотид-связывающий calcium ion binding PDZ domain binding гомодимеризация белка L-serine ammonia-lyase activity изомеразная активность glycine binding связывание с ионом металла активность катализатора активность лиазы pyridoxal phosphate binding АТФ-связанные magnesium ion binding D-serine ammonia-lyase activity serine racemase activity Компонент клетки цитоплазма клеточная мембрана apical part of cell soma цитозоль Биологический процесс response to organic cyclic compound serine family amino acid metabolic process L-serine metabolic process cellular amino acid metabolic process D-serine metabolic process старение человека pyruvate biosynthetic process response to morphine response to lipopolysaccharide D-serine biosynthetic process метаболизм protein homotetramerization развитие мозга L-serine biosynthetic process Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 63826 27364 Ensembl ENSG00000167720 ENSMUSG00000001323 UniProt Q9GZT4 Q9QZX7 RefSeq (мРНК) NM_001304803 NM_021947 NM_001163311 NM_013761 NM_001362742 NM_001362743 NM_001362744 RefSeq (белок) NP_001291732 NP_068766 NP_001156783 NP_038789 NP_001349671 NP_001349672 NP_001349673 Локус (UCSC) Chr 17: 2.3 – 2.33 Mb Chr 11: 74.8 – 74.82 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Серин-рацемаза млекопитающих - пиродоксаль 5'-фосфат зависимый фермент, катализирующий рацемацию L-серина в D-серин, а также дегидратацию(отщепление воды) L-серина с образованием пирувата и аммиака^[6]. Работа этого фермента стимулируется двухвалентными катионами металлов. Аллостерически активируется АТФ.