Родился в Швейцарии, в немецком кантоне Санкт-Галлен. Учился в Вене и Берлине. В молодости приехал в Санкт-Петербург, где получил звание техника и работал помощником архитектора А. П. Брюллова на многих казённых и частных постройках. Участвовал в конкурсе проектов постройки лютеранской церкви св. Петра и Павла, где победил проект А. П. Брюллова, Во время возведения церкви Е. Т. Цолликопфер руководил строительными работами, а в 1840 году перестраивал интерьер церкви для установки там органа[2]. Кроме того, Е. Т. Цолликопфер самостоятельно построил ряд зданий в Санкт-Петербурге и в его окрестностях, а также выполнял многочисленные заказы на перестройку и расширение частных домовладений.
Жена — София Цолликофер (урожд. Юнкер, представительница банкирской семьи Юнкеров, 1811—1873). Дети — Георг Рупрехт Иоганн, Отто Людвиг (1848—1919), Вильгельм Даниэль и Эмилия Луиза Бетти (в замужестве Гермейер, 1841 — после 1917).
Вильгельм Даниэль (Василий Егорович) Цолликофер (1849, Санкт-Петербург — 1925, Санкт-Галлен) являлся владельцем Чугунолитейного завода и председателем администрации по делам петербургского акционерного общества вагоностроительного завода «Двигатель»[4][5], занимался благотворительностью, вместе с женой Эмилией Антуанеттой (урожд. Юнкер) и детьми Львом (Людвигом) и Эмилией выступил учредителем Общества призрения бедных детей[6]. После революции уехал вместе с семьей на историческую родину, в Швейцарию.
Муж Эмилии Цолликофер — уроженец Пярну Эдуард Андреевич Гермейер (1842—1916), провизор, магистр фармации, общественный деятель, внесший значительный вклад в развитие фармацевтики Санкт-Петербурга[7], надворный советник. В 1890 году вместе с женой и детьми был признан в потомственном дворянском достоинстве с правом на внесение в третью часть Дворянской родословной книги, семья также получила личный герб, внесённый в Общий гербовник (ОГ, XV, 70)[8]. Их дочь Эмма вышла замуж за Александра Васильевича Шауба, представителя известной архитекторской семьи: его отец и брат являются авторами многих зданий в Санкт-Петербурге.
