ARNT

ARNT (сокр. от англ. Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator) — ядерный транслокатор (переносчик) рецептора ароматических углеводородов (AHR), представляет собой белок, который образует комплекс с лиганд-связанным рецептором AHR и необходим для рецепторной функции. Кодируется одноимённым геном ARNT, локализован на коротком плече (p-плече) 1-хромосомы^[5].

ARNT
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 4PKY, 1X0O, 2A24, 2B02, 2HV1, 2K7S, 3F1N, 3F1O, 3F1P, 3H7W, 3H82, 4EQ1, 4GHI, 4GS9, 4H6J, 4LPZ, 4XT2
Идентификаторы
Псевдонимы	ARNT, HIF-1-beta, HIF-1beta, HIF1-beta, HIF1B, HIF1BETA, TANGO, bHLHe2, aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator
Внешние ID	OMIM: 126110 MGI: 88071 HomoloGene: 1261 GeneCards: ARNT
Расположение гена (человек) Хр. 1-я хромосома человека[1] Локус 1q21.3 Начало 150,809,713 bp[1] Конец 150,876,708 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 3-я хромосома мыши[2] Локус 3 F2.1|3 40.74 cM Начало 95,341,699 bp[2] Конец 95,404,551 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в epithelium of colon sural nerve stromal cell of endometrium ectocervix body of uterus Наибольшая экспрессия в muscle of thigh cumulus cell Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция sequence-specific DNA binding ДНК-связывающий protein dimerization activity DNA-binding transcription factor activity transcription coactivator activity aryl hydrocarbon receptor binding transcription factor binding связывание с белками плазмы protein heterodimerization activity transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific гомодимеризация белка sequence-specific double-stranded DNA binding nuclear receptor activity Компонент клетки цитоплазма transcription regulator complex нуклеоплазма RNA polymerase II transcription regulator complex клеточное ядро ядерные тельца Биологический процесс positive regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway дифференцировка клеток response to hypoxia ДНК-зависимая регуляция транскрипции positive regulation of endothelial cell proliferation regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress positive regulation of erythrocyte differentiation embryonic placenta development mRNA transcription by RNA polymerase II positive regulation of protein sumoylation транскрипция, ДНК-зависимая ДНК-зависимая позитивная регуляция транскрипции intracellular receptor signaling pathway regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia positive regulation of vascular endothelial growth factor production positive regulation of glycolytic process положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор positive regulation of hormone biosynthetic process xenobiotic metabolic process Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 405 11863 Ensembl ENSG00000143437 ENSMUSG00000015522 UniProt P27540 P53762 RefSeq (мРНК) NM_001197325 NM_001286035 NM_001286036 NM_001668 NM_178426 NM_178427 NM_001350224 NM_001350225 NM_001350226 NM_001037737 NM_009709 RefSeq (белок) NP_001184254 NP_001272964 NP_001272965 NP_001659 NP_848514 NP_001337153 NP_001337154 NP_001337155 NP_001032826 NP_033839 Локус (UCSC) Chr 1: 150.81 – 150.88 Mb Chr 3: 95.34 – 95.4 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Закодированный белок также идентифицирован как бета-субъединица гетеродимерного транскрипционного фактора — фактора, индуцируемого гипоксией (HIF1β). Транслокация t(1; 12) (q21; p13), приводящая к слипанию с белком TEL-ARNT, связана с острым миелобластическим лейкозом. Для этого гена описаны три альтернативные сплайсированные варианты, кодирующие различные изоформы.

Рецептор ароматических углеводородов (АHR) участвует в индукции нескольких ферментов, которые участвуют в метаболизме ксенобиотиков. Лиганд-цитозольная форма рецептора ароматических углеводородов комплексно связана с белком теплового шока (Hsp90). Связывание лигандов, включаящие в себя диоксины (ТХДД) и полициклические ароматические углеводороды (ПАУ), приводит к транслокации (перемещению) лигандсвязывающей субъединицы только в^[6] клеточное ядро. Индукция ферментов, участвующих в метаболизме ксенобиотиков, происходит за счёт связывания лиганд-связанного AhR с чувствительными к ксенобиотическими элементами в промоторных областях генов для этих ферментов.

Взаимодействия с другими белками

ARNT взаимодействует со следующими белками:

• AIP,^[7][8]
• AHR,^{[9][10][11][12]}
• EPAS1,^[13]
• HIF1A,^[13][14]
• NCOA2,^[15][15]
• SIM1,^[14][16] и
• SIM2.^{[14][16][17][18]}