SMART (база данных)

SMART (Simple Modular Architecture Research Tool) — база данных, используемая при идентификации и анализе белковых доменов в белковых последовательностях ^[1][2]. SMART использует для обнаружения доменов в белковых последовательностях алгоритм, основанный на применении скрытых марковских моделей ко множественным выравниваниям. По данным на январь 2012 года SMART содержала модели 1009 доменов ^[3]. Данные SMART использовались при создании Базы Консервативных Доменов (CDD, Conserved Domain Database) и также представляются как часть базы данных InterPro.^[4]

SMART
Содержимое
Описание	Биоинформатический ресурс для идентификации белковых доменов.
Организмы	Все
Контакты
Исследовательский центр	Европейская молекулярно-биологическая лаборатория
Лаборатория	EMBL
Оригинальная публикация	PMID 18978020
Доступность
Сайт	smart.embl-heidelberg.de
Прочее
Лицензия	Free to academics, but not commercial users
Версия	7
Курирование	Да

База данных организована Европейской молекулярно-биологической лабораторией в Гейдельберге.

См. также

• PROSITE
• InterPro

Ссылки

• SMART web site