310 heliks

3₁₀ heliks je tip sekundarne strukture prisutne (retko) u proteinima.

Bočni pogled na 3₁₀-heliks alaninskih ostataka sa atomskim detaljima. Dve vodonične veze iste peptidne grupe su prikazane ljubičasto; rastojanje kiseonik-vodonik je 1.83 Å (183 ). Proteinski lanac ide na gore, i.e., nejgov -terminus je na dnu, a njegov -terminus je na vrhu slike.

Struktura

Pogled od gore na 3₁₀ heliks. Tri karbonilne grupe su usmerene na gore, i raspoređene su na krugu pod međusobnim uglovima od oko 120°. Heliks sadrži 3.0 aminokiseline po zaokretu.

Aminokiseline u 3₁₀-heliksu su raspoređene u obliku desnoruke heliksne strukture. Svaka aminokiselina odgovara zaokretu heliksa od 120° (i.e., tri ostatka po zaokretu), translaciji od 2.0 Å (= 0.2 ) duž heliksne ose, i ima 10 atoma u prstenu formiranom uspostavljanjem vodonične veze. grupa aminokiseline formira vodoničnu vezu sa grupom aminokiseline koja je tri ostatka ispred nje. Ovo ponavljajuće vodonično vezivanje definiše 3₁₀-heliks. Slične strukture su α-heliks ( vodonično vezivanje) i π-heliks vodonično vezivanje).

Ostaci u 3₁₀-heliksima tipično poprimaju (φ, ψ) diedralne uglove od oko (−49°, −26°). Diedralni uglovi su takvi da je zbir ψ diedralnog ugla jednog ostatka i φ diedralnog ugla susednog ostatka oko −75°. U poređenju s tim, zbir diedralnih uglova kod α-heliksa je oko −105°, dok je kod π-heliks oko −125°.

Opšta formula za rotacioni ugao Ω po ostatku polipeptidnog heliksa sa trans izomerima je

${\displaystyle 3\cos \Omega =1-4\cos ^{2}\left({\frac {\varphi +\psi }{2}}\right).}$

Literatura

Vidi još

• Alfa heliks
• Pi heliks
• Sekundarna struktura