Аланіл-тРНК-синтаза

Аланіл-тРНК-синтаза (англ. Alanyl-tRNA synthetase) – білок, який кодується геном AARS, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 968 амінокислот, а молекулярна маса — 106 810^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDSTLTASEI		RQRFIDFFKR		NEHTYVHSSA		TIPLDDPTLL		FANAGMNQFK
PIFLNTIDPS		HPMAKLSRAA		NTQKCIRAGG		KHNDLDDVGK		DVYHHTFFEM
LGSWSFGDYF		KELACKMALE		LLTQEFGIPI		ERLYVTYFGG		DEAAGLEADL
ECKQIWQNLG		LDDTKILPGN		MKDNFWEMGD		TGPCGPCSEI		HYDRIGGRDA
AHLVNQDDPN		VLEIWNLVFI		QYNREADGIL		KPLPKKSIDT		GMGLERLVSV
LQNKMSNYDT		DLFVPYFEAI		QKGTGARPYT		GKVGAEDADG		IDMAYRVLAD
HARTITVALA		DGGRPDNTGR		GYVLRRILRR		AVRYAHEKLN		ASRGFFATLV
DVVVQSLGDA		FPELKKDPDM		VKDIINEEEV		QFLKTLSRGR		RILDRKIQSL
GDSKTIPGDT		AWLLYDTYGF		PVDLTGLIAE		EKGLVVDMDG		FEEERKLAQL
KSQGKGAGGE		DLIMLDIYAI		EELRARGLEV		TDDSPKYNYH		LDSSGSYVFE
NTVATVMALR		REKMFVEEVS		TGQECGVVLD		KTCFYAEQGG		QIYDEGYLVK
VDDSSEDKTE		FTVKNAQVRG		GYVLHIGTIY		GDLKVGDQVW		LFIDEPRRRP
IMSNHTATHI		LNFALRSVLG		EADQKGSLVA		PDRLRFDFTA		KGAMSTQQIK
KAEEIANEMI		EAAKAVYTQD		CPLAAAKAIQ		GLRAVFDETY		PDPVRVVSIG
VPVSELLDDP		SGPAGSLTSV		EFCGGTHLRN		SSHAGAFVIV		TEEAIAKGIR
RIVAVTGAEA		QKALRKAESL		KKCLSVMEAK		VKAQTAPNKD		VQREIADLGE
ALATAVIPQW		QKDELRETLK		SLKKVMDDLD		RASKADVQKR		VLEKTKQFID
SNPNQPLVIL		EMESGASAKA		LNEALKLFKM		HSPQTSAMLF		TVDNEAGKIT
CLCQVPQNAA		NRGLKASEWV		QQVSGLMDGK		GGGKDVSAQA		TGKNVGCLQE
ALQLATSFAQ		LRLGDVKN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Аланіл-тРНК-синтаза
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4XEO, 4XEM
Ідентифікатори
Символи	AARS1, CMT2N, EIEE29, alanyl-tRNA synthetase, AARS, alanyl-tRNA synthetase 1, DEE29, TTD8, HDLS2
Зовнішні ІД	OMIM: 601065 MGI: 2384560 HomoloGene: 1213 GeneCards: AARS1
Пов'язані генетичні захворювання
Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2N, epileptic encephalopathy, early infantile, 29[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • aminoacyl-tRNA ligase activity • nucleotide binding • amino acid binding • зв’язування з іоном металу • ligase activity • RNA binding • nucleic acid binding • ATP binding • tRNA binding • alanine-tRNA ligase activity • aminoacyl-tRNA editing activity • Ser-tRNA(Ala) hydrolase activity • zinc ion binding • translation regulator activity Клітинна компонента • мембрана • мітохондрія • екзосома • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • tRNA aminoacylation • Біосинтез білків • neuromuscular process controlling balance • tRNA processing • tRNA aminoacylation for protein translation • tRNA modification • neuromuscular process • cerebellar Purkinje cell layer development • regulation of translational fidelity • alanyl-tRNA aminoacylation • aminoacyl-tRNA metabolism involved in translational fidelity • regulation of cytoplasmic translational fidelity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	16	234734
Ensembl	ENSG00000090861	ENSMUSG00000031960
UniProt	P49588	Q8BGQ7
RefSeq (мРНК)	NM_001605	NM_146217
RefSeq (білок)	NP_001596	NP_666329
Локус (UCSC)	Хр. 16: 70.25 – 70.29 Mb	Хр. 8: 111.76 – 111.78 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Цей білок за функціями належить до лігаз, аміноацил-тРНК-синтетаз. Задіяний у такому біологічному процесі як біосинтез білка. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, РНК, тРНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504