Аполіпопротеїн CI

Аполіпопротеїн CI (англ. Apolipoprotein C1) – білок, який кодується геном APOC1, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 83 амінокислот, а молекулярна маса — 9 332^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRLFLSLPVL		VVVLSIVLEG		PAPAQGTPDV		SSALDKLKEF		GNTLEDKARE
LISRIKQSEL		SAKMREWFSE		TFQKVKEKLK		IDS

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

W: Триптофан

Аполіпопротеїн CI
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ALE, 1ALF, 1IOJ, 1OPP
Ідентифікатори
Символи	APOC1, Apo-CI, ApoC-I, apo-CIB, apoC-IB, apolipoprotein C1, Apolipoprotein C-I
Зовнішні ІД	OMIM: 107710 MGI: 88053 HomoloGene: 136749 GeneCards: APOC1
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Альцгеймера[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • phospholipase inhibitor activity • lipase inhibitor activity • phosphatidylcholine binding • fatty acid binding • phosphatidylcholine-sterol O-acyltransferase activator activity Клітинна компонента • Хіломікрон • very-low-density lipoprotein particle • ендоплазматичний ретикулум • high-density lipoprotein particle • extracellular region Біологічний процес • lipid transport • chylomicron remnant clearance • negative regulation of fatty acid biosynthetic process • Обмін жирів • positive regulation of cholesterol esterification • phospholipid efflux • cholesterol metabolic process • negative regulation of phosphatidylcholine catabolic process • plasma lipoprotein particle remodeling • negative regulation of very-low-density lipoprotein particle clearance • regulation of cholesterol transport • negative regulation of receptor-mediated endocytosis • high-density lipoprotein particle remodeling • cholesterol efflux • negative regulation of cholesterol transport • negative regulation of lipoprotein lipase activity • very-low-density lipoprotein particle assembly • negative regulation of lipid catabolic process • triglyceride metabolic process • negative regulation of lipid metabolic process • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • very-low-density lipoprotein particle clearance • lipoprotein metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	341	11812
Ensembl	ENSG00000130208	ENSMUSG00000040564
UniProt	P02654	P34928
RefSeq (мРНК)	NM_001645 NM_001321065 NM_001321066 NM_001379687	NM_001110009 NM_007469
RefSeq (білок)	NP_001307994 NP_001307995 NP_001636 NP_001366616	NP_001103479 NP_031495
Локус (UCSC)	Хр. 19: 44.91 – 44.92 Mb	Хр. 7: 19.42 – 19.43 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт ліпідів. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Smit M.V.D., Kooij-Meijs E., Woudt L.P., Havekes L.M., Frants R.R. (1988). Exact localization of the familial dysbetalipoproteinemia associated HpaI restriction site in the promoter region of the APOC1 gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 152: 1282—1288. PMID 2897845 doi:10.1016/S0006-291X(88)80424-8
• Puppione D.L. (2014). Higher primates, but not New World monkeys, have a duplicate set of enhancers flanking their apoC-I genes. Comp. Biochem. Physiol. 11: 45—48. PMID 25160599 doi:10.1016/j.cbd.2014.08.001
• Rozek A., Buchko G.W., Cushley R.J. (1995). Conformation of two peptides corresponding to human apolipoprotein C-I residues 7-24 and 35-53 in the presence of sodium dodecyl sulfate by CD and NMR spectroscopy. Biochemistry. 34: 7401—7408. PMID 7779782 doi:10.1021/bi00022a013
• Rozek A., Buchko G.W., Kanda P., Cushley R.J. (1997). Conformational studies of the N-terminal lipid-associating domain of human apolipoprotein C-I by CD and 1H NMR spectroscopy. Protein Sci. 6: 1858—1868. PMID 9300485 doi:10.1002/pro.5560060906
• Rozek A., Sparrow J.T., Weisgraber K.H., Cushley R.J. (1999). Conformation of human apolipoprotein C-I in a lipid-mimetic environment determined by CD and NMR spectroscopy. Biochemistry. 38: 14475—14484. PMID 10545169 doi:10.1021/bi982966h