Валіл-тРНК-синтаза

Валіл-тРНК-синтаза (англ. Valyl-tRNA synthetase) – білок, який кодується геном VARS, розташованим у людини на короткому плечі 6-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 264 амінокислот, а молекулярна маса — 140 476^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSTLYVSPHP		DAFPSLRALI		AARYGEAGEG		PGWGGAHPRI		CLQPPPTSRT
PFPPPRLPAL		EQGPGGLWVW		GATAVAQLLW		PAGLGGPGGS		RAAVLVQQWV
SYADTELIPA		ACGATLPALG		LRSSAQDPQA		VLGALGRALS		PLEEWLRLHT
YLAGEAPTLA		DLAAVTALLL		PFRYVLDPPA		RRIWNNVTRW		FVTCVRQPEF
RAVLGEVVLY		SGARPLSHQP		GPEAPALPKT		AAQLKKEAKK		REKLEKFQQK
QKIQQQQPPP		GEKKPKPEKR		EKRDPGVITY		DLPTPPGEKK		DVSGPMPDSY
SPRYVEAAWY		PWWEQQGFFK		PEYGRPNVSA		ANPRGVFMMC		IPPPNVTGSL
HLGHALTNAI		QDSLTRWHRM		RGETTLWNPG		CDHAGIATQV		VVEKKLWREQ
GLSRHQLGRE		AFLQEVWKWK		EEKGDRIYHQ		LKKLGSSLDW		DRACFTMDPK
LSAAVTEAFV		RLHEEGIIYR		STRLVNWSCT		LNSAISDIEV		DKKELTGRTL
LSVPGYKEKV		EFGVLVSFAY		KVQGSDSDEE		VVVATTRIET		MLGDVAVAVH
PKDTRYQHLK		GKNVIHPFLS		RSLPIVFDEF		VDMDFGTGAV		KITPAHDQND
YEVGQRHGLE		AISIMDSRGA		LINVPPPFLG		LPRFEARKAV		LVALKERGLF
RGIEDNPMVV		PLCNRSKDVV		EPLLRPQWYV		RCGEMAQAAS		AAVTRGDLRI
LPEAHQRTWH		AWMDNIREWC		ISRQLWWGHR		IPAYFVTVSD		PAVPPGEDPD
GRYWVSGRNE		AEAREKAAKE		FGVSPDKISL		QQDEDVLDTW		FSSGLFPLSI
LGWPNQSEDL		SVFYPGTLLE		TGHDILFFWV		ARMVMLGLKL		TGRLPFREVY
LHAIVRDAHG		RKMSKSLGNV		IDPLDVIYGI		SLQGLHNQLL		NSNLDPSEVE
KAKEGQKADF		PAGIPECGTD		ALRFGLCAYM		SQGRDINLDV		NRILGYRHFC
NKLWNATKFA		LRGLGKGFVP		SPTSQPGGHE		SLVDRWIRSR		LTEAVRLSNQ
GFQAYDFPAV		TTAQYSFWLY		ELCDVYLECL		KPVLNGVDQV		AAECARQTLY
TCLDVGLRLL		SPFMPFVTEE		LFQRLPRRMP		QAPPSLCVTP		YPEPSECSWK
DPEAEAALEL		ALSITRAVRS		LRADYNLTRI		RPDCFLEVAD		EATGALASAV
SGYVQALASA		GVVAVLALGA		PAPQGCAVAL		ASDRCSIHLQ		LQGLVDPARE
LGKLQAKRVE		AQRQAQRLRE		RRAASGYPVK		VPLEVQEADE		AKLQQTEAEL
RKVDEAIALF		QKML

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Валіл-тРНК-синтаза
Ідентифікатори
Символи	VARS1, VARS, NDMSCA, valyl-tRNA synthetase 1, G7A, VARS2, valyl-tRNA synthetase
Зовнішні ІД	OMIM: 192150 MGI: 90675 HomoloGene: 4587 GeneCards: VARS1
Онтологія гена Молекулярна функція • aminoacyl-tRNA ligase activity • nucleotide binding • ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • aminoacyl-tRNA editing activity • valine-tRNA ligase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • tRNA aminoacylation for protein translation • Біосинтез білків • valyl-tRNA aminoacylation • aminoacyl-tRNA metabolism involved in translational fidelity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7407	22321
Ensembl	ENSG00000226589 ENSG00000096171 ENSG00000231945 ENSG00000227686 ENSG00000204394 ENSG00000224264 ENSG00000231116	ENSMUSG00000007029
UniProt	P26640	Q9Z1Q9
RefSeq (мРНК)	NM_006295	NM_011690
RefSeq (білок)	NP_006286 NP_006286.1	NP_035820
Локус (UCSC)	Хр. 6: 31.78 – 31.8 Mb	Хр. 17: 35.22 – 35.24 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Цей білок за функціями належить до лігаз, аміноацил-тРНК-синтетаз. Задіяний у такому біологічному процесі як біосинтез білка. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

• Hsieh H.-L., Campbell R.D. (1991). Evidence that gene G7a in the human major histocompatibility complex encodes valyl-tRNA synthetase. Biochem. J. 278: 809—816. PMID 1898367 doi:10.1042/bj2780809
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Vilalta A., Donovan D., Wood L., Vogeli G., Yang D.C.H. (1993). Cloning, sequencing and expression of a cDNA encoding mammalian valyl-tRNA synthetase. Gene. 123: 181—186. PMID 8428657 doi:10.1016/0378-1119(93)90122-J
• Hsieh S.-L., Campbell R.D. (1992). Biochem. J. 281: 879—879. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)