Групоспецифічний компонент

Групоспецифічний компонент (англ. GC, vitamin D binding protein) – білок, який кодується геном GC, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 474 амінокислот, а молекулярна маса — 52 964^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKRVLVLLLA		VAFGHALERG		RDYEKNKVCK		EFSHLGKEDF		TSLSLVLYSR
KFPSGTFEQV		SQLVKEVVSL		TEACCAEGAD		PDCYDTRTSA		LSAKSCESNS
PFPVHPGTAE		CCTKEGLERK		LCMAALKHQP		QEFPTYVEPT		NDEICEAFRK
DPKEYANQFM		WEYSTNYGQA		PLSLLVSYTK		SYLSMVGSCC		TSASPTVCFL
KERLQLKHLS		LLTTLSNRVC		SQYAAYGEKK		SRLSNLIKLA		QKVPTADLED
VLPLAEDITN		ILSKCCESAS		EDCMAKELPE		HTVKLCDNLS		TKNSKFEDCC
QEKTAMDVFV		CTYFMPAAQL		PELPDVELPT		NKDVCDPGNT		KVMDKYTFEL
SRRTHLPEVF		LSKVLEPTLK		SLGECCDVED		STTCFNAKGP		LLKKELSSFI
DKGQELCADY		SENTFTEYKK		KLAERLKAKL		PDATPKELAK		LVNKRSDFAS
NCCSINSPPL		YCDSEIDAEL		KNIL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Групоспецифічний компонент
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1J78, 1J7E, 1KW2, 1KXP, 1LOT, 1MA9
Ідентифікатори
Символи	GC, DBP, DBP/GRD3, HEL-S-51, VDBG, VDBP, Gc-MAF, GcMAF, vitamin D binding protein, DBP-maf, VDB, GC vitamin D binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 139200 MGI: 95669 HomoloGene: 486 GeneCards: GC
Пов'язані генетичні захворювання
vitamin metabolic disorder[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • vitamin D binding • calcidiol binding • actin binding • vitamin transmembrane transporter activity Клітинна компонента • blood microparticle • extracellular region • lysosomal lumen • екзосома • міжклітинний простір • гіалоплазма Біологічний процес • vitamin D metabolic process • GO:0070904 vitamin transport • GO:0015915 транспорт • vitamin transmembrane transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2638	14473
Ensembl	ENSG00000145321	ENSMUSG00000035540
UniProt	P02774	P21614
RefSeq (мРНК)	NM_000583 NM_001204306 NM_001204307	NM_008096
RefSeq (білок)	NP_000574 NP_001191235 NP_001191236	NP_032122
Локус (UCSC)	Хр. 4: 71.74 – 71.8 Mb	Хр. 5: 89.57 – 89.61 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Задіяний у такому біологічному процесі як транспорт. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, вітаміном D. Секретований назовні.

Література

• Cooke N.E., David E.V. (1985). Serum vitamin D-binding protein is a third member of the albumin and alpha fetoprotein gene family. J. Clin. Invest. 76: 2420—2424. PMID 2416779 doi:10.1172/JCI112256
• Braun A., Kofler A., Morawietz S., Cleve H. (1993). Sequence and organization of the human vitamin D-binding protein gene. Biochim. Biophys. Acta. 1216: 385—394. PMID 7505619 doi:10.1016/0167-4781(93)90005-X
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Schoentgen F., Metz-Boutigue M.-H., Jolles J., Constans J., Jolles P. (1986). Complete amino acid sequence of human vitamin D-binding protein (group-specific component): evidence of a three-fold internal homology as in serum albumin and alpha-fetoprotein. Biochim. Biophys. Acta. 871: 189—198. PMID 2423133 doi:10.1016/0167-4838(86)90173-1
• Svasti J., Kurosky A., Bennett A., Bowman B.H. (1979). Molecular basis for the three major forms of human serum vitamin D binding protein (group-specific component). Biochemistry. 18: 1611—1617. PMID 218624 doi:10.1021/bi00575a036
• Kofler A., Braun A., Jenkins T., Serjeantson S.W., Cleve H. (1995). Characterization of mutants of the vitamin-D-binding protein/group specific component: GC aborigine (1A1) from Australian aborigines and South African blacks, and 2A9 from south Germany. Vox Sang. 68: 50—54. PMID 7725672 doi:10.1111/j.1423-0410.1995.tb02545.x