DHFR

DHFR, дигідрофолатредуктаза (англ. Dihydrofolate reductase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 187 амінокислот, а молекулярна маса — 21 453^[6].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVGSLNCIVA		VSQNMGIGKN		GDLPWPPLRN		EFRYFQRMTT		TSSVEGKQNL
VIMGKKTWFS		IPEKNRPLKG		RINLVLSREL		KEPPQGAHFL		SRSLDDALKL
TEQPELANKV		DMVWIVGGSS		VYKEAMNHPG		HLKLFVTRIM		QDFESDTFFP
EIDLEKYKLL		PEYPGVLSDV		QEEKGIKYKF		EVYEKND

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

DHFR
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1BOZ, 1DHF, 1DLR, 1DLS, 1DRF, 1HFP, 1HFQ, 1HFR, 1KMS, 1KMV, 1MVS, 1MVT, 1OHJ, 1OHK, 1PD8, 1PD9, 1PDB, 1S3U, 1S3V, 1S3W, 1U71, 1U72, 1YHO, 2C2S, 2C2T, 2DHF, 2W3A, 2W3B, 2W3M, 3EIG, 3F8Y, 3F8Z, 3F91, 3FS6, 3GHC, 3GHV, 3GHW, 3GI2, 3GYF, 3L3R, 3N0H, 3NTZ, 3NU0, 3NXO, 3NXR, 3NXT, 3NXV, 3NXX, 3NXY, 3NZD, 3OAF, 3S3V, 3S7A, 4DDR, 4G95, 4KAK, 4KBN, 4KD7, 4KEB, 4KFJ, 4M6J, 4M6K, 4M6L, 4QHV, 4QJC
Ідентифікатори
Символи	DHFR, DHFRP1, DYR, dihydrofolate reductase
Зовнішні ІД	OMIM: 126060 MGI: 94890 HomoloGene: 56470 GeneCards: DHFR
шифр КФ	1.5.1.3
Пов'язані генетичні захворювання
constitutional megaloblastic anemia with severe neurologic disease[1]
Реагує на сполуку
метотрексат, pemetrexed, pralatrexate, триметрексат, piritrexim[2]
Онтологія гена Молекулярна функція • methotrexate binding • folic acid binding • dihydrofolate reductase activity • NADPH binding • RNA binding • oxidoreductase activity • mRNA binding • folate reductase activity • translation repressor activity, mRNA regulatory element binding • sequence-specific mRNA binding • NADP binding Клітинна компонента • гіалоплазма • цитоплазма • мітохондрія • компонент клітини Біологічний процес • response to methotrexate • dihydrofolate metabolic process • one-carbon metabolic process • axon regeneration • regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle • tetrahydrofolate metabolic process • tetrahydrofolate biosynthetic process • positive regulation of nitric-oxide synthase activity • folic acid metabolic process • tetrahydrobiopterin biosynthetic process • regulation of removal of superoxide radicals • negative regulation of translation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1719	13361
Ensembl	ENSG00000228716	ENSMUSG00000021707
UniProt	P00374	P00375
RefSeq (мРНК)	NM_000791 NM_001290354 NM_001290357	NM_010049
RefSeq (білок)	NP_000782 NP_001277283 NP_001277286	NP_034179
Локус (UCSC)	Хр. 5: 80.63 – 80.65 Mb	Хр. 13: 92.49 – 92.53 Mb
PubMed search	[3]	[4]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у таких біологічних процесах як одновуглецевий метаболізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК, НАДФ. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література

• Masters J.N., Attardi G. (1983). The nucleotide sequence of the cDNA coding for the human dihydrofolic acid reductase. Gene. 21: 59—63. PMID 6687716 doi:10.1016/0378-1119(83)90147-6
• Yang J.K., Masters J.N., Attardi G. (1984). Human dihydrofolate reductase gene organization. Extensive conservation of the G + C-rich 5' non-coding sequence and strong intron size divergence from homologous mammalian genes. J. Mol. Biol. 176: 169—187. PMID 6235374 doi:10.1016/0022-2836(84)90419-4
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Anderson D.D., Quintero C.M., Stover P.J. (2011). Identification of a de novo thymidylate biosynthesis pathway in mammalian mitochondria. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 15163—15168. PMID 21876188 doi:10.1073/pnas.1103623108
• Oefner C., D'Arcy A., Winkler F.K. (1988). Crystal structure of human dihydrofolate reductase complexed with folate. Eur. J. Biochem. 174: 377—385. PMID 3383852 doi:10.1111/j.1432-1033.1988.tb14108.x
• Cody V., Galitsky N., Luft J.R., Pangborn W., Gangjee A. (2003). Analysis of two polymorphic forms of a pyrido[2,3-d]pyrimidine N9-C10 reversed-bridge antifolate binary complex with human dihydrofolate reductase. Acta Crystallogr. D. 59: 654—661. PMID 12657784 doi:10.1107/S0907444903001951