Лімфотоксин альфа

LTA (англ. Lymphotoxin alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 205 амінокислот, а молекулярна маса — 22 297^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTPPERLFLP		RVCGTTLHLL		LLGLLLVLLP		GAQGLPGVGL		TPSAAQTARQ
HPKMHLAHST		LKPAAHLIGD		PSKQNSLLWR		ANTDRAFLQD		GFSLSNNSLL
VPTSGIYFVY		SQVVFSGKAY		SPKATSSPLY		LAHEVQLFSS		QYPFHVPLLS
SQKMVYPGLQ		EPWLHSMYHG		AAFQLTQGDQ		LSTHTDGIPH		LVLSPSTVFF
GAFAL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

LTA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1TNR, 4MXV, 4MXW
Ідентифікатори
Символи	LTA, LT, TNFB, TNFSF1, Lymphotoxin alpha, TNLG1E
Зовнішні ІД	OMIM: 153440 MGI: 104797 HomoloGene: 497 GeneCards: LTA
Онтологія гена Молекулярна функція • cytokine activity • tumor necrosis factor receptor binding • signaling receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • мембрана • клітинна мембрана • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • positive regulation of chronic inflammatory response to antigenic stimulus • response to hypoxia • response to nutrient • cell-cell signaling • positive regulation of humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin • positive regulation of interferon-gamma production • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • response to lipopolysaccharide • humoral immune response • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of apoptotic process • lymph node development • positive regulation of glial cell proliferation • negative regulation of fibroblast proliferation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • GO:0097285 апоптоз • regulation of signaling receptor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4049	16992
Ensembl	ENSG00000231408 ENSG00000223919 ENSG00000173503 ENSG00000226275 ENSG00000230279 ENSG00000238130 ENSG00000226979	ENSMUSG00000024402
UniProt	P01374	P09225
RefSeq (мРНК)	NM_000595 NM_001159740	NM_010735
RefSeq (білок)	NP_000586 NP_001153212	NP_034865
Локус (UCSC)	Хр. 6: 31.57 – 31.57 Mb	Хр. 17: 35.42 – 35.42 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Matsuyama N., Okawa N., Tsukii Y., Endo T., Kaji A. (1992). Nucleotide sequence of a cDNA encoding human tumor necrosis factor beta from B lymphoblastoid cell RPMI 1788. FEBS Lett. 302: 141—144. PMID 1353024 doi:10.1016/0014-5793(92)80425-G
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Voigt C.G., Maurer-Fogy I., Adolf G.R. (1992). Natural human tumor necrosis factor beta (lymphotoxin). Variable O-glycosylation at Thr7, proteolytic processing, and allelic variation. FEBS Lett. 314: 85—88. PMID 1451807 doi:10.1016/0014-5793(92)81467-Z
• Abraham L.J., Du D.C., Zahedi K., Dawkins R.L., Whitehead A.S. (1991). Haplotypic polymorphisms of the TNFB gene. Immunogenetics. 33: 50—53. PMID 1671667 doi:10.1007/BF00211695
• Kobayashi Y., Miyamoto D., Asada M., Obinata M., Osawa T. (1986). Cloning and expression of human lymphotoxin mRNA derived from a human T cell hybridoma. J. Biochem. 100: 727—733. PMID 3536896
• Neville M.J., Campbell R.D. (1999). A new member of the Ig superfamily and a V-ATPase G subunit are among the predicted products of novel genes close to the TNF locus in the human MHC. J. Immunol. 162: 4745—4754. PMID 10202016