Тирозил-тРНК-синтаза

Тирозил-тРНК-синтаза (англ. Tyrosyl-tRNA synthetase) – білок, який кодується геном YARS, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 528 амінокислот, а молекулярна маса — 59 143^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGDAPSPEEK		LHLITRNLQE		VLGEEKLKEI		LKERELKIYW		GTATTGKPHV
AYFVPMSKIA		DFLKAGCEVT		ILFADLHAYL		DNMKAPWELL		ELRVSYYENV
IKAMLESIGV		PLEKLKFIKG		TDYQLSKEYT		LDVYRLSSVV		TQHDSKKAGA
EVVKQVEHPL		LSGLLYPGLQ		ALDEEYLKVD		AQFGGIDQRK		IFTFAEKYLP
ALGYSKRVHL		MNPMVPGLTG		SKMSSSEEES		KIDLLDRKED		VKKKLKKAFC
EPGNVENNGV		LSFIKHVLFP		LKSEFVILRD		EKWGGNKTYT		AYVDLEKDFA
AEVVHPGDLK		NSVEVALNKL		LDPIREKFNT		PALKKLASAA		YPDPSKQKPM
AKGPAKNSEP		EEVIPSRLDI		RVGKIITVEK		HPDADSLYVE		KIDVGEAEPR
TVVSGLVQFV		PKEELQDRLV		VVLCNLKPQK		MRGVESQGML		LCASIEGINR
QVEPLDPPAG		SAPGEHVFVK		GYEKGQPDEE		LKPKKKVFEK		LQADFKISEE
CIAQWKQTNF		MTKLGSISCK		SLKGGNIS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Тирозил-тРНК-синтаза
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1N3L, 1NTG, 1Q11, 4Q93, 4QBT
Ідентифікатори
Символи	YARS1, CMTDIC, TYRRS, YRS, YTS, tyrosyl-tRNA synthetase, tyrosyl-tRNA synthetase 1, YARS, IMNEPD2
Зовнішні ІД	OMIM: 603623 MGI: 2147627 HomoloGene: 2730 GeneCards: YARS1
Пов'язані генетичні захворювання
Charcot-Marie-Tooth disease dominant intermediate C[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • aminoacyl-tRNA ligase activity • nucleotide binding • signal transducer activity • ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • interleukin-8 receptor binding • ATP binding • tyrosine-tRNA ligase activity • tRNA binding • RNA binding Клітинна компонента • міжклітинний простір • цитоплазма • ядерні тільця • гіалоплазма • aminoacyl-tRNA synthetase multienzyme complex • methionyl glutamyl tRNA synthetase complex Біологічний процес • tyrosyl-tRNA aminoacylation • Біосинтез білків • GO:0097285 апоптоз • GO:0072468 сигнальна трансдукція • tRNA aminoacylation for protein translation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8565	107271
Ensembl	ENSG00000134684	ENSMUSG00000028811
UniProt	P54577	Q91WQ3
RefSeq (мРНК)	NM_003680	NM_134151
RefSeq (білок)	NP_003671	NP_598912
Локус (UCSC)	Хр. 1: 32.78 – 32.82 Mb	Хр. 4: 129.08 – 129.11 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Цей білок за функціями належить до лігаз, аміноацил-тРНК-синтетаз. Задіяний у такому біологічному процесі як біосинтез білка. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК, тРНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Ribas de Pouplana L., Frugier M., Quinn C.L., Schimmel P. (1996). Evidence that two present-day components needed for the genetic code appeared after nucleated cells separated from eubacteria. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 166—170. PMID 8552597 doi:10.1073/pnas.93.1.166
• Kleeman T.A., Wei D., Simpson K.L., First E.A. (1997). Human tyrosyl-tRNA synthetase shares amino acid sequence homology with a putative cytokine. J. Biol. Chem. 272: 14420—14425. PMID 9162081 doi:10.1074/jbc.272.22.14420
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Yang X.-L., Skene R.J., McRee D.E., Schimmel P. (2002). Crystal structure of a human aminoacyl-tRNA synthetase cytokine. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 15369—15374. PMID 12427973 doi:10.1073/pnas.242611799