Топологічно-асоційовані домени

Топологі́чно-асоційо́вані доме́ни, ТАД (англ. topologically associating domains, TAD) — структурні ділянки геному що перебувають у близькій просторовій взаємодії одна до одної.^[1]

Структурна організація хроматину. A. Хромосомні території. B. Топологічно-асоційовані домени. C. Контакти в межах одного ТАД.

Топологічно-асоційовані домени було знайдено за допомогою методик Hi-C: фіксація конформації хромосоми^[2] з детальним секвенуванням. Ця методика встановила, що деякі регіони ДНК в геномі людини та миші мають багато контактів між собою в межах цих регіонів, а по краям розташовані ділянки, які не контактують одна з одною. Такі ділянки, розподілені за контактним принципом, назвали топологічно-асоційованими доменами.^[3]

Структура ТАД

Розміри топологічно асоційованих доменів коливаються від тисяч до мільйонів пар нуклеотидів ДНК,^[4] з середньою довжиною у ~900 kb.^[3] Розподілення геномної ДНК на ТАД є доволі консервативним, частково однакове в різних типах тканин, зберігається з клітиною впродовж поділів, та має певну консервативність порівнюючи мишачий та людські геноми.^[3]

Вища організація ТАД включає в себе компартменти A та B типів (не плутати з компартментами клітини)^[5]