Фенілаланіл-тРНК-синтаза (альфа-субодиниця)

Фенілаланіл-тРНК-синтаза (альфа-субодиниця) (англ. Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit) – білок, який кодується геном FARSA, розташованим у людини на короткому плечі 19-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 508 амінокислот, а молекулярна маса — 57 564^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADGQVAELL		LRRLEASDGG		LDSAELAAEL		GMEHQAVVGA		VKSLQALGEV
IEAELRSTKH		WELTAEGEEI		AREGSHEARV		FRSIPPEGLA		QSELMRLPSG
KVGFSKAMSN		KWIRVDKSAA		DGPRVFRVVD		SMEDEVQRRL		QLVRGGQAEK
LGEKERSELR		KRKLLAEVTL		KTYWVSKGSA		FSTSISKQET		ELSPEMISSG
SWRDRPFKPY		NFLAHGVLPD		SGHLHPLLKV		RSQFRQIFLE		MGFTEMPTDN
FIESSFWNFD		ALFQPQQHPA		RDQHDTFFLR		DPAEALQLPM		DYVQRVKRTH
SQGGYGSQGY		KYNWKLDEAR		KNLLRTHTTS		ASARALYRLA		QKKPFTPVKY
FSIDRVFRNE		TLDATHLAEF		HQIEGVVADH		GLTLGHLMGV		LREFFTKLGI
TQLRFKPAYN		PYTEPSMEVF		SYHQGLKKWV		EVGNSGVFRP		EMLLPMGLPE
NVSVIAWGLS		LERPTMIKYG		INNIRELVGH		KVNLQMVYDS		PLCRLDAEPR
PPPTQEAA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Фенілаланіл-тРНК-синтаза (альфа-субодиниця)
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3L4G
Ідентифікатори
Символи	FARSA, CML33, FARSL, FARSLA, FRSA, PheHA, phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit, phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha, RILDBC2
Зовнішні ІД	OMIM: 602918 MGI: 1913840 HomoloGene: 3280 GeneCards: FARSA
Онтологія гена Молекулярна функція • aminoacyl-tRNA ligase activity • tRNA binding • nucleotide binding • ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • phenylalanine-tRNA ligase activity • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • phenylalanine-tRNA ligase complex Біологічний процес • tRNA aminoacylation • Біосинтез білків • protein heterotetramerization • tRNA aminoacylation for protein translation • phenylalanyl-tRNA aminoacylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2193	66590
Ensembl	ENSG00000179115	ENSMUSG00000003808
UniProt	Q9Y285	Q8C0C7
RefSeq (мРНК)	NM_004461	NM_025648
RefSeq (білок)	NP_004452	NP_079924
Локус (UCSC)	Хр. 19: 12.92 – 12.93 Mb	Хр. 8: 85.58 – 85.6 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Цей білок за функціями належить до лігаз, аміноацил-тРНК-синтетаз. Задіяний у такому біологічному процесі як біосинтез білка. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Rodova M., Ankilova V., Safro M.G. (1999). Human phenylalanyl-tRNA synthetase: cloning, characterization of the deduced amino acid sequences in terms of the structural domains and coordinately regulated expression of the alpha and beta subunits in chronic myeloid leukemia cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 255: 765—773. PMID 10049785 doi:10.1006/bbrc.1999.0141
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Finarov I., Moor N., Kessler N., Klipcan L., Safro M.G. (2010). Structure of human cytosolic phenylalanyl-tRNA synthetase: evidence for kingdom-specific design of the active sites and tRNA binding patterns. Structure. 18: 343—353. PMID 20223217 doi:10.1016/j.str.2010.01.002