Фенілаланіл-тРНК-синтаза (бета-субодиниця)

Фенілаланіл-тРНК-синтаза (бета-субодиниця) (англ. Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit) – білок, який кодується геном FARSB, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 589 амінокислот, а молекулярна маса — 66 116^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPTVSVKRDL		LFQALGRTYT		DEEFDELCFE		FGLELDEITS		EKEIISKEQG
NVKAAGASDV		VLYKIDVPAN		RYDLLCLEGL		VRGLQVFKER		IKAPVYKRVM
PDGKIQKLII		TEETAKIRPF		AVAAVLRNIK		FTKDRYDSFI		ELQEKLHQNI
CRKRALVAIG		THDLDTLSGP		FTYTAKRPSD		IKFKPLNKTK		EYTACELMNI
YKTDNHLKHY		LHIIENKPLY		PVIYDSNGVV		LSMPPIINGD		HSRITVNTRN
IFIECTGTDF		TKAKIVLDII		VTMFSEYCEN		QFTVEAAEVV		FPNGKSHTFP
ELAYRKEMVR		ADLINKKVGI		RETPENLAKL		LTRMYLKSEV		IGDGNQIEIE
IPPTRADIIH		ACDIVEDAAI		AYGYNNIQMT		LPKTYTIANQ		FPLNKLTELL
RHDMAAAGFT		EALTFALCSQ		EDIADKLGVD		ISATKAVHIS		NPKTAEFQVA
RTTLLPGLLK		TIAANRKMPL		PLKLFEISDI		VIKDSNTDVG		AKNYRHLCAV
YYNKNPGFEI		IHGLLDRIMQ		LLDVPPGEDK		GGYVIKASEG		PAFFPGRCAE
IFARGQSVGK		LGVLHPDVIT		KFELTMPCSS		LEINVGPFL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Фенілаланіл-тРНК-синтаза (бета-субодиниця)
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3L4G
Ідентифікатори
Символи	FARSB, FARSLB, FRSB, PheHB, PheRS, HSPC173, phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit, phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta, NEDBLLA, RILDBC, RILDBC1
Зовнішні ІД	OMIM: 609690 MGI: 1346035 HomoloGene: 4160 GeneCards: FARSB
Онтологія гена Молекулярна функція • ligase activity • nucleotide binding • aminoacyl-tRNA ligase activity • magnesium ion binding • ATP binding • RNA binding • phenylalanine-tRNA ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • мембрана • гіалоплазма • цитоплазма • phenylalanine-tRNA ligase complex Біологічний процес • tRNA aminoacylation for protein translation • Біосинтез білків • protein heterotetramerization • phenylalanyl-tRNA aminoacylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10056	23874
Ensembl	ENSG00000116120	ENSMUSG00000026245
UniProt	Q9NSD9	Q9WUA2
RefSeq (мРНК)	NM_005687	NM_001278075 NM_011811
RefSeq (білок)	NP_005678	NP_001265004 NP_035941
Локус (UCSC)	Хр. 2: 222.57 – 222.66 Mb	Хр. 1: 78.39 – 78.47 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Цей білок за функціями належить до лігаз, аміноацил-тРНК-синтетаз. Задіяний у такому біологічному процесі як біосинтез білка. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Rodova M., Ankilova V., Safro M.G. (1999). Human phenylalanyl-tRNA synthetase: cloning, characterization of the deduced amino acid sequences in terms of the structural domains and coordinately regulated expression of the alpha and beta subunits in chronic myeloid leukemia cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 255: 765—773. PMID 10049785 doi:10.1006/bbrc.1999.0141
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Finarov I., Moor N., Kessler N., Klipcan L., Safro M.G. (2010). Structure of human cytosolic phenylalanyl-tRNA synthetase: evidence for kingdom-specific design of the active sites and tRNA binding patterns. Structure. 18: 343—353. PMID 20223217 doi:10.1016/j.str.2010.01.002