Цитидиндезаміназа

Не плутати з цитидіндезаміназами — родиною ферментів, які модифікують ДНК та РНК.

Цитидиндезаміназа (англ. Cytidine deaminase) — білок, який кодується геном CDA, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 146 амінокислот, а молекулярна маса — 16 185^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQKRPACTL		KPECVQQLLV		CSQEAKKSAY		CPYSHFPVGA		ALLTQEGRIF
KGCNIENACY		PLGICAERTA		IQKAVSEGYK		DFRAIAIASD		MQDDFISPCG
ACRQVMREFG		TNWPVYMTKP		DGTYIVMTVQ		ELLPSSFGPE		DLQKTQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

CDA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: A0A7K9BC85 PDBe A0A7K9BC85 RCSB Список кодів PDB 1MQ0
Ідентифікатори
Символи	CDA, CDD, cytidine deaminase
Зовнішні ІД	OMIM: 123920 MGI: 1919519 HomoloGene: 1352 GeneCards: CDA
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • nucleoside binding • cytidine deaminase activity • zinc ion binding • зв’язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • identical protein binding • hydrolase activity Клітинна компонента • гіалоплазма • extracellular region • secretory granule lumen • tertiary granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen Біологічний процес • cytosine metabolic process • pyrimidine nucleoside salvage • cell surface receptor signaling pathway • cytidine deamination • negative regulation of cell growth • pyrimidine-containing compound salvage • negative regulation of nucleotide metabolic process • protein homotetramerization • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	978	72269
Ensembl	ENSG00000158825	ENSMUSG00000028755
UniProt	P32320	P56389
RefSeq (мРНК)	NM_001785	NM_028176
RefSeq (білок)	NP_001776	NP_082452
Локус (UCSC)	Хр. 1: 20.59 – 20.62 Mb	Хр. 4: 138.07 – 138.1 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до підгрупи гідролаз — дезаміназ. Цей фермент каталізує реакцію відщеплення аміногрупи від нуклеотиду цитидину. Білок має сайт для зв'язування з іоном цинку.

У геномі реброплавів наявні 2 ізоформи цитидиндезамінази: CDA1 та CDA2.^[5]

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Kuhn K., Bertling W.M., Emmrich F. (1993). Cloning of a functional cDNA for human cytidine deaminase (CDD) and its use as a marker of monocyte/macrophage differentiation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 190: 1—7. PMID 8422236 doi:10.1006/bbrc.1993.1001
• Chung S.J., Fromme J.C., Verdine G.L. (2005). Structure of human cytidine deaminase bound to a potent inhibitor. J. Med. Chem. 48: 658—660. PMID 15689149 doi:10.1021/jm0496279
• Laliberte J., Momparler R.L. (1994). Human cytidine deaminase: purification of enzyme, cloning, and expression of its complementary DNA. Cancer Res. 54: 5401—5407. PMID 7923172
• Gran C., Boyum A., Johansen R.F., Lovhaug D., Seeberg E.C. (1998). Growth inhibition of granulocyte-macrophage colony forming cells by human cytidine deaminase requires the catalytic function of the protein. Blood. 91: 4127—4135. PMID 9596658