Каспаза-6

CASP6 (англ. Caspase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 293 амінокислот, а молекулярна маса — 33 310^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSASGLRRG		HPAGGEENMT		ETDAFYKREM		FDPAEKYKMD		HRRRGIALIF
NHERFFWHLT		LPERRGTCAD		RDNLTRRFSD		LGFEVKCFND		LKAEELLLKI
HEVSTVSHAD		ADCFVCVFLS		HGEGNHIYAY		DAKIEIQTLT		GLFKGDKCHS
LVGKPKIFII		QACRGNQHDV		PVIPLDVVDN		QTEKLDTNIT		EVDAASVYTL
PAGADFLMCY		SVAEGYYSHR		ETVNGSWYIQ		DLCEMLGKYG		SSLEFTELLT
LVNRKVSQRR		VDFCKDPSAI		GKKQVPCFAS		MLTKKLHFFP		KSN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

CASP6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2WDP, 3K7E, 3NKF, 3NR2, 3OD5, 3P45, 3P4U, 3QNW, 3S70, 3S8E, 3V6L, 3V6M, 4EJF, 4FXO, 4HVA, 4IYR, 4N5D, 4N6G, 4N7J, 4N7M, 4NBK, 4NBL, 4NBN
Ідентифікатори
Символи	CASP6, MCH2, Caspase 6, CSP-6
Зовнішні ІД	OMIM: 601532 MGI: 1312921 HomoloGene: 37455 GeneCards: CASP6
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity • cysteine-type peptidase activity • endopeptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • identical protein binding • cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process Клітинна компонента • гіалоплазма • нуклеоплазма • цитоплазма Біологічний процес • epithelial cell differentiation • протеоліз • GO:0097285 апоптоз • regulation of apoptotic process • execution phase of apoptosis • cellular response to staurosporine Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	839	12368
Ensembl	ENSG00000138794	ENSMUSG00000027997
UniProt	P55212	O08738
RefSeq (мРНК)	NM_001226 NM_032992	NM_009811
RefSeq (білок)	NP_001217 NP_116787	NP_033941
Локус (UCSC)	Хр. 4: 109.69 – 109.7 Mb	Хр. 3: 129.7 – 129.71 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Bartke T., Pohl C., Pyrowolakis G., Jentsch S. (2004). Dual role of BRUCE as an antiapoptotic IAP and a chimeric E2/E3 ubiquitin ligase. Mol. Cell. 14: 801—811. PMID 15200957 doi:10.1016/j.molcel.2004.05.018
• Fernandes-Alnemri T., Litwack G., Alnemri E.S. (1995). Mch2, a new member of the apoptotic Ced-3/Ice cysteine protease gene family. Cancer Res. 55: 2737—2742. PMID 7796396