本科包括以下属：

博氏藻科 Borziaceae Borzì 1914
束鞘藻科 Coleofasciculaceae
蓝藻科 Cyanothecaceae
Garwoodiaceae
- Botomaella Korde 1958
  - Botomaella decipiens (Korde 1973) Molinari and Guiry 2021^[1]
  - Botomaella zelenovi Korde 1958
- Cayeuxia Frollo 1938
- Garwoodia Wood 1941
  - Garwoodia bardosi Dragastan 1985^[2]
  - Garwoodia fluegelii Dragastan 1985
  - Garwoodia gregaria (Nicholson 1888) Wood 1941
- Ortonella Garwood 1914
  - Ortonella furcata Garwood 1914
  - Ortonella lemoineae Dragastan 1971
- Ortonellopsis Vachard and Cózar 2016
  - Ortonellopsis laxa Vachard and Cózar 2016^[3]
- Paraortonella Dragastan 1985
  - Paraortonella getica Dragastan 1985
  - Paraortonella richteri Dragastan 1985
- Scotlandella Dragastan 1985
  - Scotlandella alpina Dragastan 1985
  - Scotlandella nodosa Dragastan 1985
- Zonotrichites Bornemann 1887
戈芒藻科 Gomontiellaceae
Gomontielloideae
- 发毛针藻属 Crinalium
- Cyanarcus
- Gomontiella
- Starria
Hormoscilloideae
- Hormoscilla
- Katagnymene
须藻科 Homoeotrichaceae Elenkin 1949
微鞘藻科 Microcoleaceae (Hansgirg 1889) Komárek et al. 2014
颤藻科 Oscillatoriaceae Engler 1898
席藻科 Phormidiaceae
- 微鞘藻亚科 Microcoleoideae
  - 水鞘藻属 Hydrocoleum
  - 鞘丝藻属 Lyngbyopsis
  - 微鞘藻属 Microcoleus
  - 束丝藻属 Sirocoleum
  - Symplocastrum
- 席藻亚科 Phormidioideae
伪鱼腥藻科 Pseudanabaenaceae
Heteroleibleinoideae
- Heteroleibleinia
- Sokolovia
- 微丝藻属 Tapinothrix
- 伪项圈藻亚科 Pseudanabaenoideae
- Arthronema
- Geitlerinema
- Jaaginema
- Leibleinia
- 瘦鞘丝藻属 Leptolyngbya
- 湖生蓝丝藻属 Limnothrix
- Planktolyngbya
- 伪项圈藻属 Pseudanabaena
- 罗氏藻属 Romeria
裂须藻科 Schizotrichaceae

科的地位未定的属：

Atractella Printz 1921
Chthonoblastus Kützing 1843
Hillbrichtia
Jasser et al. 2022
- Hillbrichtia pamiria Jasser et al. 2022^[4]
Marsacia Brown et al. 2010
Olisthonema
Panou and Gkelis 2022
- Olisthonema eestii Panou and Gkelis 2022^[5]
Pseudoscillatoria Rasoulouniriana et al. 2009

颤藻目

螺旋藻属 Spirulina
科学分类
域：	细菌域 Bacteria
门：	蓝菌门 Cyanobacteria
纲：	蓝藻纲 Cyanophyceae
目：	颤藻目 Oscillatoriales Cavalier-Smith, 2002
科
见正文

下属分类

参照

参考文献