ZC45病毒与ZXC21病毒

ZC45病毒（SL-CoV ZC45）与ZXC21病毒（SL-CoV ZXC21），被部分媒体称为舟山蝙蝠病毒^[1]，皆为严重急性呼吸道综合征相关冠状病毒（SARSr-CoV）的病毒株，在中国浙江舟山的小菊头蝠样本中发现，于2018年发表。这两个病毒株属于SARS-CoV-2的演化支^[2]，全基因组核酸序列与SARS-CoV-2的相似度约为88%^[3][4]，与SARS-CoV的相似度则约为81%^[5]。

ZC45病毒与ZXC21病毒
病毒分类
（未分级）：	病毒 Virus
域：	核糖病毒域 Riboviria
界：	正核糖病毒界 Orthornavirae
门：	小核糖病毒门 Pisuviricota
纲：	小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目：	套式病毒目 Nidovirales
科：	冠状病毒科 Coronaviridae
属：	乙型冠状病毒属 Betacoronavirus
亚属：	SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus
种：	SARSr-CoV
毒株：	ZC45病毒与ZXC21病毒 ZC45；ZXC21

发现

2015年至2017年间，研究人员在浙江舟山采集334只小菊头蝠样本，发现其中含有多种冠状病毒序列，其中有两个新病毒株（即ZC45与ZXC21）的基因组被完整定序，分别长29802与29732nt，彼此基因组序列相似度为97%。这两个病毒株的基因组序列与SARS-CoV相似度约为81%，刺突蛋白（S）氨基酸序列和SARS-CoV的相似度则为77%，皆低于Rs3367等数种较早发现的蝙蝠SARSr-CoV和SARS-CoV的相似度，且两病毒刺突蛋白的S1次单元氨基酸序列和其他蝙蝠SARSr-CoV差异较大，与其相似度最高者（Rs806）亦仅有83%。动物实验显示ZC45病毒可感染实验大鼠，在多个器官造成发炎，其中以脑组织最为明显^[5]。

与SARS-CoV-2的相似

2020年1月，2019冠状病毒病疫情甫爆发后，研究人员定序SARS-CoV-2的基因组，发现ZC45与ZXC21是当时已知核酸序列与SARS-CoV-2相似度最高的病毒，约有88%^{[注 1]}，高于SARS-CoV-2与SARS-CoV相似度的82%^[2]，共同组成一演化支，不过两病毒与与SARS-CoV-2在刺突蛋白的相似度较低，核酸序列的相似度约为75%，其中在S2次单元的相似度比S1次单元的高许多，在位于S1末端、与宿主细胞受体结合的受体结合结构域（receptor binding domain, RBD）相似度仅约60%，低于SARS-CoV-2与SARS-CoV在此的相似度（约74%）^[4][6]。

争议

主条目：闫丽梦 § 指控中华人民共和国政府隐瞒2019冠状病毒病疫情事件

2020年9月，前香港大学病毒学研究员闫丽梦在美国发表未经同行评审的论文，指控SARS-CoV-2并非自然产生，而是在实验室经改造ZC45与ZXC21（或称“舟山蝙蝠病毒”）而成的人造病毒，论文指出SARS-CoV-2基因组中的许多特征不见于其他冠状病毒，且ZC45与ZXC21的序列和其“十分相似”，很可能是制作SARS-CoV-2的来源模板，而与SARS-CoV-2关系接近、但在疫情爆发后才发表的RaTG13病毒、RmYN02病毒与穿山甲冠状病毒可能为虚构^[7][8]。此论文的可信度受到诸多学者批评^[9]，许多病毒学家表示ZC45与ZXC21和SARS-CoV-2的序列差异大于10%，约有3500个碱基不同，差异已大到几乎不可能为人工制造^[10]，有学者并形容此论文为垃圾科学^[11]。

演化树

SARS-CoV-2与相关病毒株的系统发生树^[12][13] :

	Rc-o319 与SARS-CoV-2相似度81 % · 角菊头蝠 · 日本岩手县 （2013年采集、2020年发表）[14]         SL-ZXC21 88 % · 小菊头蝠 · 中华人民共和国浙江舟山（2015年采集、2018年发表）[5]     SL-ZC45 88 % · 小菊头蝠 · 中华人民共和国浙江舟山（2017年采集、2018年发表）[5]         Pangolin-CoV-GX 85.5 % · 马来穿山甲 · 东南亚 （2017年采集、2020年发表）[15]       Pangolin-CoV-GD 90.1 % · 马来穿山甲 · 东南亚 （2019年采集、2020年发表）[16]         RshSTT182 92.6 % · 扁颅菊头蝠（英语：Rhinolophus shameli） · 柬埔寨上丁省 （2010年采集、2021年发表）[13]     RshSTT200 92.6 % · 扁颅菊头蝠 · 柬埔寨上丁省 （2010年采集、2021年发表）[13]         RacCS203（英语：RacCS203） 91.5 % · 大角菊头蝠（英语：Rhinolophus acuminatus） · 泰国差春骚府 （2020年采集、2021年发表）[12]     RmYN02 93.3 % · 马来亚菊头蝠 · 中华人民共和国云南勐腊 （2019年采集、2020年发表）[4]         RaTG13 96.2 % · 中菊头蝠 · 中华人民共和国云南墨江 （2013年采集、2020年发表）[17]     BANAL-52 96.8 % · 马来亚菊头蝠 · 老挝永珍省 （2020年采集、2022年发表）[18]     SARS-CoV-2 100 %
	SARS-CoV 79%

  蝙蝠病毒

  穿山甲病毒

  人类病毒