第三世代的宝可梦是指在2002年发售的《宝可梦 红宝石／蓝宝石》与2004年的《宝可梦 火红／叶绿》中引入的135种新的虚构生物，下表列出第三世代的宝可梦，以游戏中名为“宝可梦图鉴”的百科全书所提供的编号排列，自编号252的木守宫至编号386的代欧奇希斯。