消毒(英语:disinfection)是利用化学品或其他方法消灭大部份微生物,使常见的致病细菌数目减少到安全的水平。然而,与灭菌(sterilization)相比,部份细菌孢子、滤过性病毒、结核杆菌及真菌等都可能没有消灭。
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消毒剂通常用于日常生活所接触的事物,如地板、餐具,在医疗上则只可用于一些体外的工具(如探热针)。
消毒的方式一般可使用酒精、甲醛、氨水、漂白水、环氧乙烷、碘液等常用消毒剂进行喷洒擦拭乃至清洗,甚至简单的沸水浸洗和蒸煮,也有使用紫外光照射进行消毒等。