视窗系统(英语:windowing system)是以使用视窗作为主要特征之一的图形用户介面的构成元件。更为明确地说,它是桌面环境的构成元件。视窗系统支撑著视窗管理员的实作(implementation);视窗系统为“图像硬体(graphics hardware)、指向装置(pointing devices)提供基本支持。绘制滑鼠游标,一般也与视窗系统相关。
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从程式设计师的观点来看,视窗系统实作出绘图的基本单位,像是字型绘制,或是在萤幕上划线,有效地提供绘图硬体的一种抽象概念。
视窗系统能让电脑使用者同时让数个程式工作。每个程式在他自己的视窗中执行,不互相干扰也就是萤幕上的矩形之中。大部份的视窗系统允许视窗重叠,且提供使用者执行标准的操作,像是移动/改变视窗尺寸,把视窗送到前景/背景,和最小化/最大化一个视窗。其他还有像是拉著视窗碰撞某个边改变视窗尺寸等。
有些视窗系统,比如说X窗口系统,拥有先进的网路穿透性能力,允许使用者在远端机器上执行图形化的应用程式。