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上游开放阅读框

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上游开放阅读框(Upstream open reading frame,简称uORF)是位于真核生物mRNA5′非翻译区(5′ UTR)的开放阅读框(ORF),可调控(一般为抑制)mRNA主要ORF的转译,少数案例中(如酵母菌Gcn4基因)uORF则可促进主要开放阅读框的转译[1],为细胞调控基因表现的机制之一[2][3]

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具uORF的mRNA示意图

人类基因中约有50%在mRNA的5′ UTR具有uORF,一般长2至100个密码子,多为抑制主要开放阅读框的转译[4],有些mRNA含有超过一个uORF[5]。uORF的异常可能与癌症及数种遗传疾病有关[5]

机制

转译起始时43S起始前复合物会自mRNA的5′往3′移动以寻找起始密码子,遇到uORF的起始密码子时即会开始转译,转译uORF时核糖体可能发生停滞(并启动无义介导的mRNA降解),或在结束转译后脱离mRNA,不再继续转译下游的主要ORF,因此抑制主要ORF的基因表现,40S核糖体亚基也可能在完成uORF的转译时继续结合在mRNA上并往3′移动,找到主ORF的起始密码子并重新启动转译[5]。长度较长、距主要ORF较近或具核酸二级结构而促使核糖体停滞的uORF较易抑制主ORF的转译[5]

43S起始前复合物寻找起始密码子时,某些情况下也会跳过uORF,直接转译主要的开放阅读框,此机制与uORF的位置与周边序列有关[5]。另外许多uORF的起始密码子并非AUG,而是其他类似的密码子,其中以CUG最多,其次为GUG(约与AUG数量相等),再次为UUG[5]

uORF转译生成的多肽产物可由质谱仪测得[6],其中有些可参与转译调控,或与细胞中其他蛋白结合而影响其他反应[5]

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参考文献

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